More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29320  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 240 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2608  conserved protein DedA family  58.43 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3102  conserved protein DedA family  49.34 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1143  DedA family protein  42.38 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1144  hypothetical protein  39.92 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.44715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0665  SNARE associated Golgi protein-related protein  44.9 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1216  SNARE associated Golgi protein  41.84 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1217  SNARE associated Golgi protein  40.3 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000759752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0621  putative membrane-associated protein  50.88 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5260  DedA family membrane protein  37.63 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13040  uncharacterized membrane-associated protein  34.74 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0449285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1908  hypothetical protein  39.89 
 
 		 209 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0837244  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0145  SNARE associated Golgi protein  40.33 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34371  decreased coverage  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0139  hypothetical protein  40.11 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04950  uncharacterized membrane-associated protein  35.79 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0766  hypothetical protein  32.92 
 
 		 200 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0780  hypothetical protein  32.92 
 
 		 200 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0760  hypothetical protein  32.92 
 
 		 200 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0293  hypothetical protein  33.73 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4801  SNARE associated Golgi protein  33.13 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  38.96 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  30.68 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  33.53 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  31.94 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  26.09 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  29.23 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  27.78 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  30.85 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  29.78 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  29.63 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0616  DedA family protein  32.18 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  29.63 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  30.39 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  29.94 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  26.29 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  29.94 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  29.55 
 
 		 355 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  29.94 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  26.49 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.16 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  32.48 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  30.62 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  32.69 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  29.25 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.76 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.42 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.43 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  30.57 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  24.51 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0212  putative membrane-associated protein  34.84 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  30.77 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  24.14 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  24.67 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  23.12 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  27.21 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  36.52 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  23.98 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  33.09 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  33.96 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0744  SNARE associated Golgi protein  33.54 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  26.17 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.27 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4919  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.07 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19679  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  30.16 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2075  DedA family protein  24.49 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  25.66 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  29.01 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  29.01 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  25.12 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0484  hypothetical protein  20.69 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.849747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  27.61 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.61 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  22.81 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  24.03 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.32 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  27.81 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  23.46 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  24.38 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  24.36 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  25.3 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  26.92 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  27.87 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  22.99 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.43 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  29.08 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  20.99 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>