82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  100 
 
 		 539 aa  1027    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.62 
 
 		 550 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  56.25 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  50 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  45.44 
 
 		 539 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  44.97 
 
 		 590 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  46.52 
 
 		 537 aa  346  5e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  44.15 
 
 		 525 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  43.95 
 
 		 525 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  43.95 
 
 		 525 aa  329  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  47.19 
 
 		 532 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  37.72 
 
 		 578 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  37.69 
 
 		 542 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  45.98 
 
 		 532 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  40.49 
 
 		 564 aa  276  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  42.05 
 
 		 586 aa  264  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  40.11 
 
 		 802 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  39.78 
 
 		 673 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  40.07 
 
 		 555 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  35.92 
 
 		 547 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  41.56 
 
 		 568 aa  246  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  37.41 
 
 		 568 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  33.4 
 
 		 589 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  44 
 
 		 524 aa  183  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  45.7 
 
 		 518 aa  182  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  34.94 
 
 		 552 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  46.4 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  40.81 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  45.87 
 
 		 523 aa  168  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  29.88 
 
 		 619 aa  89  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  34.08 
 
 		 631 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  36.2 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  31.21 
 
 		 571 aa  74.3  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  37.65 
 
 		 566 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  35.62 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  34.02 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  32.13 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  30.22 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  27.88 
 
 		 687 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  34.73 
 
 		 551 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  31.94 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  35.75 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  31.36 
 
 		 566 aa  63.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  32.73 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  31.22 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.49 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  28.85 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  32.5 
 
 		 669 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  28.95 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  33.51 
 
 		 572 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  28.95 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  30.77 
 
 		 543 aa  56.2  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  37.31 
 
 		 586 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  37.31 
 
 		 586 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  37.31 
 
 		 576 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  28.49 
 
 		 642 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  26.09 
 
 		 1249 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  30.8 
 
 		 737 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  37.5 
 
 		 565 aa  52.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  34.04 
 
 		 629 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  27.31 
 
 		 564 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  29.72 
 
 		 784 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  28.5 
 
 		 769 aa  50.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.32 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  30.96 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  25.13 
 
 		 583 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  24.29 
 
 		 589 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  31.07 
 
 		 650 aa  47.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  23.33 
 
 		 1228 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  25.53 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  22.63 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  27.57 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  26.32 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  29.29 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  27.27 
 
 		 778 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  27.47 
 
 		 727 aa  43.9  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  26.24 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  26.24 
 
 		 452 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  25.64 
 
 		 484 aa  43.5  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  24.47 
 
 		 440 aa  43.5  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  46.67 
 
 		 556 aa  43.5  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>