More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05920 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 507 aa  1022    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  60.74 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2769  extracellular solute-binding protein  48.28 
 
 		 507 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12042  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  45.8 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 		 492 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.2 
 
 		 492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.9 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26350  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  38 
 
 		 526 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  38.22 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 		 492 aa  286  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.44 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  34 
 
 		 493 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 489 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  35.62 
 
 		 508 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 494 aa  269  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  34.43 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3049  extracellular solute-binding protein family 5  34.59 
 
 		 503 aa  247  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  32.74 
 
 		 501 aa  242  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  32.15 
 
 		 499 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  31.89 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0887  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.545524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0816  extracellular solute-binding protein family 5  33.91 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  32.17 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0919  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  31.13 
 
 		 539 aa  224  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.654123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4355  extracellular solute-binding protein family 5  31.86 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0355555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3619  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 495 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.43082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0139  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5441  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 497 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.876365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 536 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1058  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 563 aa  203  6e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.271211 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  29.39 
 
 		 503 aa  195  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.59 
 
 		 542 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.17 
 
 		 520 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  32.06 
 
 		 510 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  31.08 
 
 		 526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  30.18 
 
 		 509 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.85 
 
 		 524 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  33.18 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 544 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.28 
 
 		 539 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.84 
 
 		 534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.8 
 
 		 538 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.08 
 
 		 532 aa  173  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.45 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  34.66 
 
 		 524 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1196  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  29.12 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.419054  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.09 
 
 		 534 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 		 515 aa  170  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  32.09 
 
 		 534 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 511 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 544 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 510 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.76 
 
 		 546 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 540 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  29.64 
 
 		 528 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 510 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 		 529 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  30.17 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.93 
 
 		 515 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.85 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  28 
 
 		 541 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  26.65 
 
 		 540 aa  163  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.66 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  33.43 
 
 		 514 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2569  ABC transporter substrate-binding protein  28.76 
 
 		 558 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.217608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 582 aa  160  6e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 528 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2197  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 503 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  27.61 
 
 		 531 aa  158  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  32.37 
 
 		 514 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.4 
 
 		 503 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 517 aa  157  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.29 
 
 		 533 aa  157  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 508 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  31.4 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2671  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.699901  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0365  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.76 
 
 		 521 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.52 
 
 		 512 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.71 
 
 		 527 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>