111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2576 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  87.77 
 
 
639 aa  1200    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  98.59 
 
 
639 aa  1309    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  100 
 
 
639 aa  1324    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  97.34 
 
 
639 aa  1275    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  64.89 
 
 
639 aa  871    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  84.33 
 
 
639 aa  1159    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  65.16 
 
 
639 aa  848    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  84.48 
 
 
639 aa  1162    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  62.62 
 
 
646 aa  802    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  83.7 
 
 
639 aa  1139    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  60.51 
 
 
640 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  84.33 
 
 
639 aa  1160    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  33.99 
 
 
650 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  33.69 
 
 
650 aa  334  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  33.79 
 
 
650 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  33.63 
 
 
650 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  33.58 
 
 
650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  33.43 
 
 
650 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  33.09 
 
 
656 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  29.32 
 
 
663 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  30.77 
 
 
655 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  32.17 
 
 
667 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  30.84 
 
 
671 aa  257  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  30.06 
 
 
653 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  31.71 
 
 
656 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.18 
 
 
785 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  30.42 
 
 
660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  27.34 
 
 
764 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  29.65 
 
 
671 aa  210  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  25.68 
 
 
714 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  27.2 
 
 
727 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  25.16 
 
 
745 aa  152  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  25.98 
 
 
731 aa  151  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  26.73 
 
 
730 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  27.24 
 
 
730 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  27.6 
 
 
735 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  26.62 
 
 
729 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  26.83 
 
 
730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  26.25 
 
 
731 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  25.28 
 
 
782 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  25.7 
 
 
822 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  26.45 
 
 
724 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  25.27 
 
 
719 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  25.04 
 
 
716 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  24.73 
 
 
720 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  24.3 
 
 
722 aa  134  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.36 
 
 
742 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  28.62 
 
 
742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  28.25 
 
 
742 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  25.18 
 
 
833 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.76 
 
 
895 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.1 
 
 
724 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.47 
 
 
826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  24.9 
 
 
745 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  25 
 
 
725 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  24.45 
 
 
764 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 
741 aa  124  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  23.28 
 
 
738 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  22.91 
 
 
936 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  28.53 
 
 
885 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.02 
 
 
820 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  24.42 
 
 
755 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  22.37 
 
 
893 aa  111  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  23.77 
 
 
762 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  24.5 
 
 
762 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  24.12 
 
 
762 aa  106  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 
761 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.71 
 
 
764 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  23.73 
 
 
758 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.58 
 
 
764 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.67 
 
 
761 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  23.32 
 
 
762 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.72 
 
 
766 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  24.68 
 
 
765 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  23.67 
 
 
754 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  23.2 
 
 
729 aa  94.7  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  29.79 
 
 
843 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  26.4 
 
 
809 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  21.78 
 
 
731 aa  90.9  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  25.38 
 
 
898 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  26.8 
 
 
898 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  24.63 
 
 
788 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  26.8 
 
 
898 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  28.26 
 
 
741 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  23.8 
 
 
677 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  26.55 
 
 
945 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  23.92 
 
 
657 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  25.22 
 
 
757 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  23.13 
 
 
770 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  28.22 
 
 
612 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  22.74 
 
 
778 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  23.11 
 
 
816 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  31.9 
 
 
789 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  31.9 
 
 
788 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  31.9 
 
 
789 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  28.8 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  30.48 
 
 
642 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  26.26 
 
 
701 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  26.26 
 
 
701 aa  61.6  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  26.26 
 
 
701 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>