44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0160 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0155  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 170 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0160  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 170 aa  343  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.90437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0155  general secretion pathway protein H  97.06 
 
 		 190 aa  336  9e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0170  general secretion pathway protein H  96.47 
 
 		 190 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3563  general secretion pathway protein H  87.65 
 
 		 190 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0157  general secretion pathway protein H  84.21 
 
 		 204 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0153  general secretion pathway protein H  83.63 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4202  general secretion pathway protein H  83.63 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0157  general secretion pathway protein H  83.63 
 
 		 191 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0109  general secretion pathway protein H  68.24 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3615  general secretion pathway protein H  66.67 
 
 		 192 aa  234  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4730  general secretion pathway protein H  68.07 
 
 		 193 aa  231  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.129836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0148  general secretion pathway protein H  65.06 
 
 		 210 aa  229  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4354  general secretion pathway protein H  64.24 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0125  general secretion pathway protein H  62.43 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0173  general secretion pathway protein H  60 
 
 		 189 aa  207  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2390  general secretion pathway protein H  26.63 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000294923 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2920  general secretion pathway protein H precursor  31.36 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001888  general secretion pathway protein H  32.16 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03960  putative general secretion pathway protein H precursor  34.31 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0235  general secretion pathway protein H  27.67 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0232  general secretion pathway protein H  28 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2302  general secretion pathway protein H  25.33 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24040  general secretion pathway outer membrane protein H precursor  26.57 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4587  general secretion pathway protein H  25 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.248042  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2033  general secretion pathway protein H  26.57 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00605  general secretion pathway protein H  31.98 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3243  general secretion pathway protein GspH  26.9 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.793793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02834  GspH, hypothetical type II secretion protein  26.9 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000472105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0101  general secretion pathway protein H  30.07 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3134  general secretion pathway protein H  26.9 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02784  hypothetical protein  26.9 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000039643  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3408  general secretion pathway protein GspH  26.9 
 
 		 187 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3423  general secretion pathway protein H  26.32 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1352  general secretion pathway protein H  23.81 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3576  hypothetical protein  22.89 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1315  type II secretory pathway protein LspH  22.46 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2373  general secretion pathway protein H  25.3 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03180  predicted general secretory pathway component, cryptic  25.16 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03131  hypothetical protein  25.16 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0384  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.105042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3523  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1312  type II secretory pathway protein LspH  21.74 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0384  general secretion pathway protein H  25.16 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>