More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3446 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  89.63 
 
 		 299 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  89.3 
 
 		 299 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  87.96 
 
 		 299 aa  527  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  81.61 
 
 		 299 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  81.94 
 
 		 299 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  82.27 
 
 		 299 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  82.27 
 
 		 299 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  80.94 
 
 		 299 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  81.21 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  81.21 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  81.21 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  81.21 
 
 		 299 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  80.54 
 
 		 299 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  77.85 
 
 		 299 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  79.53 
 
 		 299 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  46.51 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.43 
 
 		 292 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  42.86 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  42.26 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  46.53 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  46.69 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  43.14 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  42.04 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  37.22 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  42.51 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.55 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.55 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  38.49 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.17 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  41.04 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  41.51 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  40.27 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  35 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  35 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  34.58 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  35.86 
 
 		 327 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.89 
 
 		 321 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  34.76 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  35.86 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.86 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  32.07 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  44.03 
 
 		 332 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  37.04 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  44.03 
 
 		 328 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  35.21 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  34.62 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.95 
 
 		 442 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  42.16 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.71 
 
 		 454 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  51.61 
 
 		 443 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  51.72 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.61 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  54.31 
 
 		 457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  35.22 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  43.11 
 
 		 459 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  30.26 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.59 
 
 		 455 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  52.59 
 
 		 456 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.17 
 
 		 459 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42.11 
 
 		 445 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.51 
 
 		 402 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.65 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.82 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.28 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  52.5 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.33 
 
 		 238 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  32.29 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.1 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.72 
 
 		 430 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  49.59 
 
 		 413 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.69 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  31.28 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.58 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  38.95 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  49.14 
 
 		 439 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  49.14 
 
 		 440 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  47.54 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.75 
 
 		 524 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  41.8 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  48.33 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.69 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.68 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.02 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  45.76 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.26 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  49.6 
 
 		 233 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.02 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.18 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.09 
 
 		 430 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.09 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.28 
 
 		 399 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  43.06 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  37.72 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  47.83 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.31 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.88 
 
 		 460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  44.83 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.9 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>