147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2723 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  71.02 
 
 		 180 aa  264  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  67.61 
 
 		 173 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  59.89 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  58.19 
 
 		 176 aa  221  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  56.67 
 
 		 205 aa  217  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  59.09 
 
 		 172 aa  217  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 		 172 aa  210  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  56.25 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 182 aa  207  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  53.41 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  54.7 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 180 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  54.7 
 
 		 176 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 176 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  51.93 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  52.49 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  48.04 
 
 		 175 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  36.42 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  35.76 
 
 		 171 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0668  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.42 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.31 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.31 
 
 		 156 aa  47.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.88 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1651  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057152  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  27.56 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  46.34 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1088  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.31 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.62 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1378  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000389327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  36.49 
 
 		 325 aa  45.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 303 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 137 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.62 
 
 		 134 aa  44.3  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  47.5 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2744  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 151 aa  44.3  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  35.8 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1836  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.38 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  28.04 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.38 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1769  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.38 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.58 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  45 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28.23 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  45 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  40.91 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  45 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  45 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1117  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.91 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  32.23 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.14 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>