123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3264 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
896 aa  1840    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.5 
 
 
866 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  40.87 
 
 
864 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  41.79 
 
 
869 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  41.62 
 
 
879 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.94 
 
 
859 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.79 
 
 
868 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.79 
 
 
868 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  42.22 
 
 
892 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  37.81 
 
 
860 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  41.73 
 
 
866 aa  599  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  40.44 
 
 
862 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.07 
 
 
878 aa  555  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.81 
 
 
881 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  34.25 
 
 
567 aa  289  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.2 
 
 
585 aa  247  9e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.16 
 
 
588 aa  232  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  28.23 
 
 
995 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.89 
 
 
1016 aa  163  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.29 
 
 
998 aa  141  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  28.64 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  27.86 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  24.9 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  29.02 
 
 
779 aa  64.3  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  26.44 
 
 
795 aa  63.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.75 
 
 
302 aa  62.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.61 
 
 
887 aa  58.9  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.57 
 
 
725 aa  58.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
726 aa  58.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  27.57 
 
 
364 aa  57.8  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  28.25 
 
 
877 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  29.09 
 
 
790 aa  57.4  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  26.17 
 
 
795 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  28.96 
 
 
804 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  28.63 
 
 
795 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.4 
 
 
889 aa  55.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  23.86 
 
 
793 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 
788 aa  55.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.84 
 
 
902 aa  55.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  26.65 
 
 
803 aa  54.7  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.47 
 
 
835 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  28.96 
 
 
793 aa  54.3  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  27.16 
 
 
789 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  26.63 
 
 
334 aa  52.8  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  25.45 
 
 
885 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  25.45 
 
 
885 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  35.16 
 
 
923 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  24.16 
 
 
884 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  25.86 
 
 
794 aa  51.6  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  28.74 
 
 
812 aa  51.6  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 
799 aa  51.2  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.77 
 
 
1097 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  26.47 
 
 
799 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  22.38 
 
 
830 aa  50.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  26.33 
 
 
812 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  25.54 
 
 
784 aa  50.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  26.2 
 
 
790 aa  50.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.37 
 
 
840 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.86 
 
 
811 aa  50.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  27.03 
 
 
792 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  24.79 
 
 
814 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  27.11 
 
 
788 aa  49.7  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  28.74 
 
 
810 aa  48.9  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.43 
 
 
971 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.4 
 
 
884 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0638  Pyruvate, water dikinase  28.95 
 
 
312 aa  48.5  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  27.3 
 
 
794 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  27.3 
 
 
794 aa  48.5  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  27.3 
 
 
794 aa  48.5  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  28.03 
 
 
758 aa  48.5  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  34.18 
 
 
854 aa  48.5  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  25.48 
 
 
794 aa  48.1  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  25.6 
 
 
790 aa  48.1  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  30.26 
 
 
907 aa  48.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  26.03 
 
 
789 aa  48.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.95 
 
 
873 aa  48.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  25.45 
 
 
780 aa  48.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  30.83 
 
 
826 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  25.67 
 
 
790 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  26.67 
 
 
803 aa  47.8  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.31 
 
 
810 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  26.73 
 
 
791 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.86 
 
 
869 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 
789 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 
789 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 
789 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  31 
 
 
842 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.17 
 
 
975 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  31 
 
 
842 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.11 
 
 
867 aa  47  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  26.25 
 
 
794 aa  46.6  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  27.39 
 
 
758 aa  47  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  27.78 
 
 
793 aa  47  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  24.09 
 
 
808 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  28.21 
 
 
893 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  28.03 
 
 
796 aa  47  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  25.56 
 
 
789 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  21.39 
 
 
758 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  25.52 
 
 
792 aa  46.6  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  24.5 
 
 
789 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>