More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3094 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3094  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1064  lysine exporter protein LysE/YggA  78.92 
 
 		 204 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150207  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1031  lysine exporter protein LysE/YggA  78.92 
 
 		 204 aa  331  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0778058  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0890  lysine exporter protein LysE/YggA  79.9 
 
 		 204 aa  331  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3132  lysine exporter protein LysE/YggA  79.9 
 
 		 204 aa  331  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0962  lysine exporter protein LysE/YggA  78.92 
 
 		 204 aa  330  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.55802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3224  lysine exporter protein LysE/YggA  79.9 
 
 		 204 aa  331  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  78.92 
 
 		 229 aa  328  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3328  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  78.43 
 
 		 204 aa  327  7e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0974  lysine exporter protein LysE/YggA  77.94 
 
 		 204 aa  318  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253527  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 204 aa  317  6e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  75.98 
 
 		 205 aa  314  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  75 
 
 		 204 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3318  lysine exporter protein LysE/YggA  77.45 
 
 		 204 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.3253  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  69.72 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2833  amino acid transporter LysE  72.55 
 
 		 208 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318432  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0391  hypothetical protein  57.84 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000550  putative threonine efflux protein  55.39 
 
 		 204 aa  238  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05339  putative threonine efflux protein  56.32 
 
 		 187 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3935  lysine exporter protein LysE/YggA  50.25 
 
 		 203 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2828  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2922  lysine exporter protein LysE/YggA  43.28 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1150  amino acid transporter LysE  39.58 
 
 		 204 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0372  lysine exporter protein LysE/YggA  39.91 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83228  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  30.69 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.37 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.83 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  29.95 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.47 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  31.18 
 
 		 205 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.43 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.87 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 		 209 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.02 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  31.22 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  29.15 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.79 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  31.71 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  28.99 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 		 230 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  28.14 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.69 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.2 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.69 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.2 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.2 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30.19 
 
 		 214 aa  88.2  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  30.35 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  28.14 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  34.39 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  29.1 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  30.69 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2771  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.6 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  31.12 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  32.28 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.09 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  26.85 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  32.21 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  28.99 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.15 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2833  hypothetical protein  36.99 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.14 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.18 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  29.17 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  34.15 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  28.65 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  28.49 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  32.46 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  37.3 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  25.65 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  35.48 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  29.5 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  28.64 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  27.16 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  28.8 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>