More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1982 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  100 
 
 		 213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  81.73 
 
 		 216 aa  364  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  78.5 
 
 		 214 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  73.93 
 
 		 220 aa  350  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  72.04 
 
 		 230 aa  332  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  70.56 
 
 		 214 aa  320  9.000000000000001e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  70.53 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  71.83 
 
 		 213 aa  300  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  66.35 
 
 		 219 aa  298  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  58.77 
 
 		 223 aa  274  8e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  57.82 
 
 		 214 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  54.93 
 
 		 213 aa  261  4e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  55.4 
 
 		 213 aa  258  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  55.71 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  53.52 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  52.47 
 
 		 240 aa  250  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  52.8 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  52.36 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  54.38 
 
 		 229 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  53.66 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4147  Peroxiredoxin  53.66 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  53.88 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  53.52 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  51.71 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  54.76 
 
 		 232 aa  235  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.74 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  51.63 
 
 		 225 aa  227  8e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  51.39 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  51.66 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  51.66 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  51.64 
 
 		 212 aa  224  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  53.11 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  51.42 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.23 
 
 		 225 aa  217  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  53.81 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0463  peroxiredoxin  50.74 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  49.07 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.24 
 
 		 216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2700  Peroxiredoxin  51.85 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.936444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3741  1-Cys peroxiredoxin  51.1 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  49.31 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  49.53 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.51 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  50 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.8 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.71 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  47.22 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  47.71 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  47.85 
 
 		 230 aa  201  8e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  48.58 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  48.83 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  51.03 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  49.06 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  47.42 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  49.75 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  47.64 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  46.05 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  49.53 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  49.06 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  48.53 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  49.06 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  48.58 
 
 		 217 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  45.89 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  44.13 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  45.5 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.67 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0349  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.15 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0457086 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  47.17 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4131  1-cysteine peroxiredoxin  44.93 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3015  peroxidase  45.5 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183076  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  44.33 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2721  Peroxidase  46.03 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  45.6 
 
 		 213 aa  177  7e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6623  peroxidase  43.75 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  42 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3666  peroxidase  47.64 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.771523 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  42 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2437  peroxidase  46.03 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0481  peroxidase  50.78 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.892211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4192  Peroxidase  44.23 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0504041 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  46.99 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4984  peroxidase  42.51 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10223  putative 1-Cys peroxiredoxin (Eurofung)  43.94 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0264885  normal  0.0244812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0181  peroxidase  44.44 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2449  1-Cys peroxiredoxin  42 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.642142  hitchhiker  0.00248484 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0696  1-Cys peroxiredoxin  42.5 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.835421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  42.79 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1201  Peroxidase  42.5 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0625929 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0667  peroxidase  42.5 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0456031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1551  1-Cys peroxiredoxin  41.79 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010067  normal  0.0309578 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  46.28 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03973  mitochondrial peroxiredoxin (Eurofung)  43.94 
 
 		 261 aa  168  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.24863  normal  0.436872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0498  1-Cys peroxiredoxin  44.39 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  41 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0179  1-Cys peroxiredoxin  42.27 
 
 		 210 aa  167  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2654  1-Cys peroxiredoxin  40.8 
 
 		 212 aa  168  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  42.86 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  40.5 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  42.86 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0775  Peroxidase  40.8 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.280469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>