More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2521 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 390 aa  806    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  86.34 
 
 		 394 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  74.87 
 
 		 397 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  74.87 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  74.87 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  74.37 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  74.3 
 
 		 397 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  73.1 
 
 		 397 aa  607  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  72.84 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  72.84 
 
 		 397 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  72.84 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  71.28 
 
 		 392 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  73.33 
 
 		 392 aa  591  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  73.01 
 
 		 391 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  71.54 
 
 		 392 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  69.74 
 
 		 393 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  59.42 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  53.57 
 
 		 392 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  51.3 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  51.03 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  49.49 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  50.91 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  51.17 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 391 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 391 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  49.07 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  50.39 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  48.96 
 
 		 398 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  49.74 
 
 		 397 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  48.06 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  48.14 
 
 		 407 aa  364  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  45.92 
 
 		 394 aa  363  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  48.44 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.67 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.93 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 		 399 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  48.44 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  46.48 
 
 		 400 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.19 
 
 		 397 aa  349  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.1 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.3 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.3 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  46.55 
 
 		 386 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  46.15 
 
 		 393 aa  346  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.56 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  46.04 
 
 		 386 aa  345  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.07 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  46.29 
 
 		 386 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.26 
 
 		 397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  46.11 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.16 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 386 aa  338  7e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  42.23 
 
 		 414 aa  338  7e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.87 
 
 		 394 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.71 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  46.74 
 
 		 386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  44.42 
 
 		 378 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.87 
 
 		 394 aa  335  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.15 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.33 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.84 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  45.29 
 
 		 392 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  42.38 
 
 		 392 aa  332  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  45.08 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.84 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 377 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.99 
 
 		 393 aa  329  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.79 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 		 377 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  46.53 
 
 		 401 aa  329  6e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 		 377 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.51 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  44.94 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.94 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.73 
 
 		 397 aa  325  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 		 377 aa  325  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.68 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  42.64 
 
 		 377 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.95 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>