194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2108 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 386 aa  775    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  35.17 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  30.25 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3385  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 385 aa  173  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  25.72 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  25.31 
 
 		 428 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  21.95 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  21.51 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.9 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  21.87 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  22.43 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  22.29 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  20.99 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  23.7 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  21.54 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  22.34 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.16 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  23.1 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  20.88 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  22.44 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 241 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  22.16 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  22.19 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  20.56 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  22.59 
 
 		 372 aa  57  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  23.32 
 
 		 241 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  21.56 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  19.67 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  20.16 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  21.03 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  20.2 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  22.28 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  24.12 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  20.22 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 		 367 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.5 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.41 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.86 
 
 		 257 aa  54.7  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  21.5 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  23.33 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  23.33 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  23.82 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  22.02 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  19.37 
 
 		 396 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1796  ABC-2 type transporter  18.06 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  20.55 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  23.29 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  20.41 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  20.3 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  23.35 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.97 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  27.86 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  20.62 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  20.35 
 
 		 379 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  22.31 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2485  ABC-2 type transporter  20.75 
 
 		 369 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  22.22 
 
 		 339 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2864  ABC transporter, permease protein, putative  20.75 
 
 		 369 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141451  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  21.45 
 
 		 378 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  19.55 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.25 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  22.78 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  20.91 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  19.27 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  20.82 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  30.17 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  22.78 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2116  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.906215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  23.33 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  20.76 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  19.9 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.2 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>