More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2075 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2075  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0358  formate dehydrogenase, alpha subunit (selenocysteine-containing)  75.28 
 
 		 940 aa  283  7e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.721212  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0805  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  62.92 
 
 		 186 aa  249  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1504  formate dehydrogenase  62.5 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.93 
 
 		 934 aa  233  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0820  formate dehydrogenase alpha subunit  58.05 
 
 		 932 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.380979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 		 949 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  52.57 
 
 		 949 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  52 
 
 		 949 aa  197  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.43 
 
 		 949 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  50.84 
 
 		 949 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.12 
 
 		 949 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  52 
 
 		 949 aa  195  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  50.84 
 
 		 949 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  49.14 
 
 		 950 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  49.14 
 
 		 950 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  49.71 
 
 		 950 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  49.71 
 
 		 950 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  49.14 
 
 		 950 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  49.14 
 
 		 950 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  50 
 
 		 951 aa  191  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  50 
 
 		 951 aa  191  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  52.46 
 
 		 986 aa  191  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  49.14 
 
 		 950 aa  190  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  47.87 
 
 		 951 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  50.28 
 
 		 953 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4129  molybdopterin oxidoreductase  47.83 
 
 		 957 aa  188  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.06 
 
 		 950 aa  186  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  49.2 
 
 		 951 aa  184  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  47.43 
 
 		 951 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  47.43 
 
 		 951 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  47.19 
 
 		 951 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  47.31 
 
 		 964 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1286  formate dehydrogenase alpha subunit  51.41 
 
 		 962 aa  181  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  47.43 
 
 		 951 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  46.86 
 
 		 950 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  46.29 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  46.29 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  45.71 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  45.71 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  46.29 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  45.71 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  46.29 
 
 		 950 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.02 
 
 		 950 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  44.21 
 
 		 973 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1170  formate dehydrogenase large subunit precursor  47.16 
 
 		 988 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.970148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  45.65 
 
 		 973 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  47.98 
 
 		 987 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  43.93 
 
 		 989 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  47.13 
 
 		 994 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  53.73 
 
 		 980 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  53.73 
 
 		 980 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  43.35 
 
 		 989 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  46.02 
 
 		 991 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  52.38 
 
 		 980 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  54.69 
 
 		 979 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  43.93 
 
 		 1025 aa  164  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  52.99 
 
 		 980 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  45.51 
 
 		 1012 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  44.89 
 
 		 991 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  44.38 
 
 		 970 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3261  twin-arginine translocation pathway signal  43.43 
 
 		 986 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.303919  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  41.21 
 
 		 992 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  43.35 
 
 		 983 aa  160  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  43.5 
 
 		 996 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  46.59 
 
 		 1001 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  46.59 
 
 		 1001 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  43.75 
 
 		 999 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  40.8 
 
 		 1111 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.17 
 
 		 662 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  37.12 
 
 		 745 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.61 
 
 		 135 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.85 
 
 		 886 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 657 aa  100  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.57 
 
 		 721 aa  99.8  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 676 aa  99  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.81 
 
 		 685 aa  99.4  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.16 
 
 		 657 aa  98.6  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.09 
 
 		 1020 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2946  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  34.85 
 
 		 135 aa  98.2  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.750797  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 676 aa  97.8  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2089  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.57 
 
 		 191 aa  97.8  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.578931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0453  molybdopterin oxidoreductase  30.41 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.57 
 
 		 1020 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.61 
 
 		 676 aa  95.9  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.09 
 
 		 355 aa  95.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.61 
 
 		 718 aa  94.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 677 aa  94.4  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 		 674 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.88 
 
 		 893 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 		 674 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 		 674 aa  92.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2268  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.41 
 
 		 190 aa  92.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 		 984 aa  92  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 		 984 aa  92  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  34.11 
 
 		 363 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.08 
 
 		 674 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.41 
 
 		 1009 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2590  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.57 
 
 		 196 aa  88.6  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.59 
 
 		 893 aa  89  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>