83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0538 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
309 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  47.35 
 
 
302 aa  270  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  28.38 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  27.05 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  25.43 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  26.47 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  27.04 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  25.71 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  26.42 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  24.81 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  24.83 
 
 
292 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.46 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.46 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.46 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.46 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  24.34 
 
 
305 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  24.34 
 
 
305 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  23.87 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  22.53 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  25.46 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.09 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  28.09 
 
 
308 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23.69 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  21.33 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  27.92 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.34 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  22.68 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.94 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  21.48 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  24.74 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.26 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.38 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  28.08 
 
 
327 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 
316 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  24.28 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  23.74 
 
 
325 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  23.3 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  21.99 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  29.84 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  22.9 
 
 
295 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  23.37 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  20.41 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  21.37 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  25.52 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  22.61 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  21.28 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  29.57 
 
 
294 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  20.99 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  24.58 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  21.05 
 
 
311 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25.11 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  23.16 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.11 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
315 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.53 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.52 
 
 
312 aa  45.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  23.14 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  22.13 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  23.88 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  24.75 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  24.4 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  20.85 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  23.42 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.3 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  23 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  21.67 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.71 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.71 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  25.71 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  26.99 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  21.18 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
295 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
329 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  21.01 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  31.03 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 
311 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>