More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1427 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  55.13 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  50.28 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 179 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  53.46 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  49.15 
 
 		 203 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  49.15 
 
 		 203 aa  187  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  51.14 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 203 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  47.65 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  50 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  47.68 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  45.18 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  48.12 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  44.63 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  43.5 
 
 		 186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  44.91 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  41.51 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  43.56 
 
 		 208 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  44 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  40.43 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  43.21 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  42.19 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 212 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  40.12 
 
 		 231 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  42.37 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  40.24 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  40.76 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  41.4 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  42.04 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  38.73 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  41.03 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  40.91 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  37.97 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  39.87 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 195 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  38.75 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 158 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  40.51 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  42.14 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 162 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  35.8 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  40 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  41.43 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  40 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  40 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  38.96 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  40.15 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  42.18 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  42.65 
 
 		 158 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  42.18 
 
 		 165 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  41.96 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  42.03 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  40.94 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 160 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  39.86 
 
 		 163 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  39.72 
 
 		 158 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  39.13 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.19 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  41.5 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  42.42 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  35.03 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  39.87 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  41.26 
 
 		 161 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0282  Glutathione peroxidase  39.13 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  40.74 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  40.58 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  39.58 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  38.41 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  39.26 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  40.29 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  37.68 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>