More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0278 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  99.29 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  99.29 
 
 		 283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  95.76 
 
 		 283 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  90.36 
 
 		 284 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  89.25 
 
 		 279 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  88.17 
 
 		 279 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  87.77 
 
 		 279 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  87.41 
 
 		 279 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  76.62 
 
 		 279 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  74.37 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  72.95 
 
 		 286 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0098  PfkB  71.07 
 
 		 282 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  68.21 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  70 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  71.53 
 
 		 292 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  27.64 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  26.96 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  26.58 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  25.55 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  24.91 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  28.41 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  22.61 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  24.42 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  26.5 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  26.4 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  21.63 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  21.71 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  21.96 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  23.08 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  24.6 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  23.81 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.13 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  25.4 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  25.82 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.49 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  27.73 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  27.02 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  22.14 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  25.51 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  23.96 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.81 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  26.72 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.46 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  26.34 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.06 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  25.09 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  24.29 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.78 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  24.68 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  24.29 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2838  fructokinase  20.2 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.050359  normal  0.34699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  23.69 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  27.85 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  26.24 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.57 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  22.26 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  23.61 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1600  PfkB domain protein  23.41 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  26.28 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.75 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  23.6 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  23.79 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  23.61 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  26.09 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  26.09 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  25.91 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  20.93 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  24.29 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  23.48 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  24.29 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  26.22 
 
 		 401 aa  54.7  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.76 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  24.9 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  25.42 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  23.1 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  23.51 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  25.38 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  24.7 
 
 		 336 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  27.91 
 
 		 316 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.62 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.16 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  22.58 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  25.08 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  25.38 
 
 		 337 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  25.38 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  23.11 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.45 
 
 		 404 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 316 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  23.51 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>