269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3788 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 		 371 aa  732    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  63.06 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  45.7 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  45.55 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  37.69 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  41.98 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  32.52 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  34.66 
 
 		 450 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  34.07 
 
 		 481 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  28.4 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 451 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  36.64 
 
 		 454 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 		 442 aa  122  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.48 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  29.39 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.32 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  23.43 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  28.82 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  29 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  22.65 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  27.5 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.4 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  31.4 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  28.3 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  23.11 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1836  multidrug resistance efflux pump-like  24.47 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0902612  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  22.83 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  29.08 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  22.3 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  22.3 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  22.3 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  22.89 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  22.3 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  22.3 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  22.3 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3328  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.94 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  26.07 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  22.39 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4177  multidrug resistance efflux pump-like  23.94 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4189  multidrug resistance efflux pump-like protein  23.94 
 
 		 431 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.45 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  30.84 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.6 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  27.27 
 
 		 343 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  25.11 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 		 472 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1936  transporter, putative  29.74 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  30.18 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1812  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.19 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4233  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1104  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  26.28 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4421  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.53 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4281  secretion protein HlyD family protein  26.07 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3455  hypothetical protein  28.17 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 289 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  23.81 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.76 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  28.46 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1186  secretion protein HlyD family protein  27.07 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502575  normal  0.193359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  23.81 
 
 		 370 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0119  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  26.35 
 
 		 288 aa  50.4  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  23.81 
 
 		 370 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 		 286 aa  50.4  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  32.21 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 373 aa  50.1  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4909  secretion protein HlyD family protein  23.42 
 
 		 404 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.070438 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1634  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.7 
 
 		 417 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  27.14 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  26.37 
 
 		 457 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.97 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  25 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  25.96 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  25.56 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0056  putative type I secretion protein, HlyD family  26.73 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  27.6 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  31.48 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3238  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0467  RND family efflux transporter MFP subunit  27.72 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>