More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1654 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1654  isoamylase  100 
 
 		 588 aa  1195    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3764  glycogen debranching enzyme GlgX  55.42 
 
 		 649 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2744  glycogen debranching enzyme GlgX  55.69 
 
 		 654 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3352  glycogen debranching enzyme GlgX  55.09 
 
 		 659 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  55.27 
 
 		 658 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0211  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  48.21 
 
 		 1410 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4135  glycogen debranching enzyme  46.58 
 
 		 658 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4119  glycogen debranching enzyme  45.78 
 
 		 662 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.548863 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4005  glycogen debranching enzyme  45.01 
 
 		 662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0148  glycogen debranching enzyme  45.18 
 
 		 662 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4646  glycogen debranching enzyme  43.76 
 
 		 661 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.298898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3936  glycogen debranching enzyme  45.98 
 
 		 658 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2452  glycogen operon protein  44.72 
 
 		 689 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03283  glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000400543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4743  glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3893  glycogen debranching enzyme  44.27 
 
 		 657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  42.21 
 
 		 701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03236  hypothetical protein  44.1 
 
 		 657 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00116729  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0283  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 		 657 aa  445  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3713  glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 657 aa  444  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.723997  normal  0.535779 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0281  glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 657 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00281975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3727  glycogen debranching enzyme  44.05 
 
 		 658 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3846  glycogen debranching enzyme  44.05 
 
 		 658 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.825937 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3631  glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 657 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3738  glycogen debranching enzyme  44.05 
 
 		 658 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3910  glycogen debranching enzyme  44.1 
 
 		 657 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3907  glycogen debranching enzyme  44.05 
 
 		 658 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.385353  normal  0.48763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3804  glycogen debranching enzyme  44.05 
 
 		 658 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3839  glycogen debranching enzyme  45.11 
 
 		 657 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.90909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  43.99 
 
 		 716 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 702 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  44.86 
 
 		 704 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  45.07 
 
 		 700 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1486  glycogen debranching enzyme GlgX  44.24 
 
 		 705 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 751 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.71 
 
 		 723 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  42.71 
 
 		 695 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  43.63 
 
 		 733 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 702 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.2 
 
 		 755 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  41.91 
 
 		 738 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  41.11 
 
 		 733 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  42.52 
 
 		 688 aa  432  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  41.96 
 
 		 704 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  44.32 
 
 		 720 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  43.7 
 
 		 752 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  43.7 
 
 		 752 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  43.7 
 
 		 752 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.37 
 
 		 758 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  43.43 
 
 		 754 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  42.83 
 
 		 750 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.17 
 
 		 714 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  43.54 
 
 		 707 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1887  glycogen debranching enzyme GlgX  44.25 
 
 		 758 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0704358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 		 721 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  41.5 
 
 		 698 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  45.08 
 
 		 704 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  41.91 
 
 		 738 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  41.71 
 
 		 733 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.17 
 
 		 714 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.37 
 
 		 758 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  42.64 
 
 		 716 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 		 726 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  42.53 
 
 		 733 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  42.64 
 
 		 716 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.17 
 
 		 714 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  43.17 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  42.55 
 
 		 718 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0278  glycogen debranching enzyme  43.63 
 
 		 655 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 		 697 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  40.58 
 
 		 728 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.09 
 
 		 720 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0224  glycogen debranching enzyme  44.04 
 
 		 656 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  44.05 
 
 		 709 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  42.36 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  45.36 
 
 		 704 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  43.06 
 
 		 733 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  42.97 
 
 		 712 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  41.6 
 
 		 756 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  43.23 
 
 		 733 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  46.49 
 
 		 701 aa  421  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  44.39 
 
 		 727 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  43.41 
 
 		 733 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  43.68 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  41.75 
 
 		 719 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  42.71 
 
 		 721 aa  420  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  42.32 
 
 		 691 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  43.36 
 
 		 709 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 733 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  40.1 
 
 		 752 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.68 
 
 		 723 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 713 aa  422  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  44.8 
 
 		 755 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  43.87 
 
 		 694 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  44.23 
 
 		 779 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  45.03 
 
 		 704 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  41.92 
 
 		 688 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  44.8 
 
 		 757 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  44.32 
 
 		 720 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.46 
 
 		 710 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>