148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4663 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4663  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  90 
 
 
320 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.86 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.4 
 
 
348 aa  265  8e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  50.48 
 
 
357 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3688  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.86 
 
 
331 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1792  hypothetical protein  51.99 
 
 
314 aa  222  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  46.38 
 
 
356 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  41.64 
 
 
342 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  39.18 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  42.54 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  42.54 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.77 
 
 
331 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.115319  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  42.22 
 
 
359 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3998  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.88 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.631873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1854  hypothetical protein  46.07 
 
 
295 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
328 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  36.33 
 
 
324 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.37 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  35.54 
 
 
333 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1942  hypothetical protein  36.59 
 
 
322 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5067  hypothetical protein  33.77 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  32.14 
 
 
351 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8407  hypothetical protein  32.04 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201495  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  28.48 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2037  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.8 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
530 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.16 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  26.87 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  21.19 
 
 
304 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  23.29 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 
520 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  22.8 
 
 
290 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  23.58 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.45 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.08 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  22.26 
 
 
322 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.33 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  24.6 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  24 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.51 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  23.38 
 
 
295 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
298 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  27.13 
 
 
297 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1048  hypothetical protein  27.91 
 
 
323 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.766524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
302 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
305 aa  52.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  21.59 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  40.78 
 
 
301 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  24.31 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.21 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.41 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  29.61 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.51 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  30.73 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.84 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.95 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 
288 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.2 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.12 
 
 
296 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.896113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.93 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  21.5 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  32.8 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  28.17 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  25.1 
 
 
308 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  30.14 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  30.32 
 
 
358 aa  49.7  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0269  hypothetical protein  24.55 
 
 
583 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.29 
 
 
297 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  24.41 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  24.41 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  21.68 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0897  hypothetical protein  28.7 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0962881  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  27.19 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  24.41 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  24.41 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1567  DMT family permease  22.73 
 
 
173 aa  48.9  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.13 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  24.41 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  33.17 
 
 
278 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  25.17 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.55 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  26.67 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.75 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  23.78 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  24.6 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  29.29 
 
 
296 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.08 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  28.02 
 
 
292 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1713  hypothetical protein  33.06 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165922  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  21.57 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  21.79 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>