More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3298 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  62.06 
 
 
624 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  62.18 
 
 
648 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  62.96 
 
 
628 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  61.36 
 
 
631 aa  668    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  58.63 
 
 
627 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  64.96 
 
 
642 aa  754    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  58.05 
 
 
622 aa  662    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  60.67 
 
 
654 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
622 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  62.68 
 
 
638 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  61.87 
 
 
640 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  67.95 
 
 
640 aa  819    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  60.84 
 
 
641 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  62.81 
 
 
627 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  61.42 
 
 
627 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  60.26 
 
 
637 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  61.35 
 
 
632 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  61.67 
 
 
636 aa  734    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  61.07 
 
 
637 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  61.35 
 
 
638 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  60.29 
 
 
648 aa  702    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  59.59 
 
 
634 aa  725    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  59.37 
 
 
627 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  61.42 
 
 
627 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.84 
 
 
614 aa  669    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  62.02 
 
 
663 aa  664    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  67.85 
 
 
642 aa  818    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  100 
 
 
658 aa  1297    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  61.86 
 
 
626 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  61.27 
 
 
659 aa  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  95.21 
 
 
658 aa  1163    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  64.24 
 
 
622 aa  761    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  56.55 
 
 
639 aa  635    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  59.39 
 
 
620 aa  662    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  58.7 
 
 
632 aa  658    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  69.28 
 
 
632 aa  841    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  60.68 
 
 
687 aa  735    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  56.63 
 
 
635 aa  631  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  55.99 
 
 
631 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  56.57 
 
 
638 aa  623  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  55.5 
 
 
624 aa  608  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  48.71 
 
 
628 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  44.15 
 
 
648 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  47.1 
 
 
626 aa  515  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
623 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  42.83 
 
 
593 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
594 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.97 
 
 
671 aa  412  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  42.59 
 
 
607 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  41.33 
 
 
635 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  36.92 
 
 
611 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  40.48 
 
 
589 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.41 
 
 
598 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  40.82 
 
 
613 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.9 
 
 
601 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.46 
 
 
575 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.71 
 
 
626 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  37.64 
 
 
608 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34 
 
 
586 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34 
 
 
586 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.42 
 
 
613 aa  362  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.78 
 
 
586 aa  360  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 
586 aa  360  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.17 
 
 
586 aa  360  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.83 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.83 
 
 
586 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  37.27 
 
 
582 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.83 
 
 
586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.67 
 
 
586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.83 
 
 
586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.97 
 
 
614 aa  355  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 
571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.1 
 
 
571 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.1 
 
 
571 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 
571 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.1 
 
 
571 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.71 
 
 
597 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.71 
 
 
597 aa  352  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.19 
 
 
585 aa  350  5e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 
571 aa  350  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.61 
 
 
641 aa  350  7e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.93 
 
 
571 aa  349  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.93 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.93 
 
 
571 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.93 
 
 
571 aa  349  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.63 
 
 
577 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.87 
 
 
572 aa  348  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  33.16 
 
 
578 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  33.16 
 
 
578 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.26 
 
 
598 aa  346  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  38.99 
 
 
600 aa  344  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.58 
 
 
600 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.83 
 
 
578 aa  342  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  37.56 
 
 
665 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.09 
 
 
617 aa  340  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.33 
 
 
602 aa  340  7e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  35.06 
 
 
580 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  33.93 
 
 
609 aa  336  7.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.05 
 
 
597 aa  334  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>