More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2612 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  100 
 
 
208 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  75 
 
 
208 aa  315  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  74.76 
 
 
208 aa  310  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  57.84 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  63.18 
 
 
203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  47.12 
 
 
217 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  48.99 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  47.62 
 
 
216 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  41.38 
 
 
205 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  41.38 
 
 
205 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  44.39 
 
 
206 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  41.38 
 
 
205 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  45.85 
 
 
206 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  42.31 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  40 
 
 
396 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  40.78 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  37.69 
 
 
206 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  41.83 
 
 
217 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  35.89 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  40.78 
 
 
221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  41.08 
 
 
189 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  41.38 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  39.9 
 
 
210 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  42.65 
 
 
198 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  44 
 
 
210 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  40.49 
 
 
196 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 
253 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
215 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  43.28 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  37.96 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  37.02 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
227 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  42.14 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  40.88 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  42.76 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  33.49 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  40.97 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  39.67 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  39.86 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.92 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
544 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  37.65 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  34.92 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.57 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  39.17 
 
 
280 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  37.04 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  35.34 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  44.59 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
282 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  32.82 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  32.17 
 
 
212 aa  58.2  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  34.59 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  36.43 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  36.76 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.33 
 
 
271 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  31.65 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  30.66 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
382 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0660  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
303 aa  55.8  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.27 
 
 
256 aa  55.5  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  37.68 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
265 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
286 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
261 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  37.27 
 
 
274 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
290 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  40.32 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  36.47 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.66 
 
 
305 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5849  Methyltransferase type 12  30.95 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  40.35 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  43.14 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  43.14 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  27.33 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  42.86 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  40.32 
 
 
314 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2932  methyltransferase type 12  43.14 
 
 
188 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202849  normal  0.0386986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  44.21 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.32 
 
 
305 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  27.91 
 
 
278 aa  52.8  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  35.66 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
269 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
188 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>