60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2216 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  92.74 
 
 		 436 aa  745    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 427 aa  839    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  37.18 
 
 		 681 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  36.61 
 
 		 504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 		 626 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  35.38 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  35.6 
 
 		 1356 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  34.02 
 
 		 461 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  32.97 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  33.64 
 
 		 855 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  33.68 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  33.66 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  29.7 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  36.7 
 
 		 774 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  31.87 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  26.72 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 319 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  35.34 
 
 		 777 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  26.75 
 
 		 787 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  29.77 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  30 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  35.24 
 
 		 982 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  32.59 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  27.43 
 
 		 251 aa  48.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  28.95 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  25.6 
 
 		 157 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  28.21 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 		 618 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  25.35 
 
 		 1313 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 		 608 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  24.09 
 
 		 936 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  25.21 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4480  von Willebrand factor, type A  26.78 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  29.49 
 
 		 327 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 		 788 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 625 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  25.73 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2751  hypothetical protein  31.21 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 715 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 373 aa  44.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  23.64 
 
 		 317 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  23.62 
 
 		 609 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2880  hypothetical protein  27.8 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 		 607 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  24.78 
 
 		 328 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  29.06 
 
 		 795 aa  43.1  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  26.43 
 
 		 339 aa  43.1  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>