228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1189 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 764 aa  1427    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  87.96 
 
 		 764 aa  1171    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  52.6 
 
 		 780 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  49.35 
 
 		 761 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.68 
 
 		 791 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.14 
 
 		 832 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 		 837 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 		 837 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  43.32 
 
 		 837 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  48.39 
 
 		 812 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  41.3 
 
 		 824 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  42.59 
 
 		 822 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  46.04 
 
 		 771 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  43.38 
 
 		 787 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  44.92 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  44.86 
 
 		 785 aa  426  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  43.22 
 
 		 860 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  42.9 
 
 		 808 aa  411  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  46.13 
 
 		 778 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.25 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  41.67 
 
 		 707 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  45.02 
 
 		 640 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  45.74 
 
 		 598 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.76 
 
 		 622 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.67 
 
 		 571 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  34.53 
 
 		 596 aa  260  6e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.22 
 
 		 894 aa  239  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.84 
 
 		 894 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  25.66 
 
 		 899 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.69 
 
 		 924 aa  217  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 898 aa  217  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 852 aa  208  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  28.46 
 
 		 943 aa  204  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.8 
 
 		 902 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  27.74 
 
 		 895 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.95 
 
 		 930 aa  200  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  30.02 
 
 		 930 aa  200  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.13 
 
 		 905 aa  200  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.41 
 
 		 900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  27.56 
 
 		 883 aa  197  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.7 
 
 		 927 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.91 
 
 		 900 aa  197  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.71 
 
 		 930 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 		 858 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.44 
 
 		 931 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  30.28 
 
 		 930 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.62 
 
 		 887 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  28.08 
 
 		 884 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  26.53 
 
 		 936 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  28.33 
 
 		 884 aa  189  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  29.29 
 
 		 881 aa  188  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  29.78 
 
 		 899 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  25.79 
 
 		 865 aa  187  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  29.35 
 
 		 899 aa  187  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3611  PII uridylyl-transferase  28.34 
 
 		 893 aa  187  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434009  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  29.04 
 
 		 899 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  33.39 
 
 		 850 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  26.24 
 
 		 887 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.69 
 
 		 864 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  27.24 
 
 		 877 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  28.85 
 
 		 900 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  28.67 
 
 		 900 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  28.07 
 
 		 861 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  27.28 
 
 		 862 aa  181  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  28.06 
 
 		 900 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  25.79 
 
 		 861 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  29.05 
 
 		 930 aa  180  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  29.05 
 
 		 930 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  28.67 
 
 		 900 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  26.92 
 
 		 862 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  25.66 
 
 		 861 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 861 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  25.97 
 
 		 934 aa  178  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.89 
 
 		 870 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  27.53 
 
 		 895 aa  177  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  29 
 
 		 900 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  25.46 
 
 		 933 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  29.26 
 
 		 856 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  25.22 
 
 		 861 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  28.27 
 
 		 874 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  27.51 
 
 		 892 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.57 
 
 		 935 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  26.71 
 
 		 869 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  28.37 
 
 		 898 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  25.61 
 
 		 933 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.55 
 
 		 893 aa  172  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 861 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 861 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  24.97 
 
 		 857 aa  171  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  25.56 
 
 		 860 aa  170  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 861 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  27.77 
 
 		 885 aa  170  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  26.61 
 
 		 875 aa  170  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  27.96 
 
 		 904 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  29.51 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  29.51 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  29.51 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  28.8 
 
 		 914 aa  169  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  26.63 
 
 		 857 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>