237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3147 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 786 aa  1516    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  49.05 
 
 		 761 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.84 
 
 		 780 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  48.89 
 
 		 771 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  43.85 
 
 		 707 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  40.39 
 
 		 824 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.04 
 
 		 791 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  40.72 
 
 		 837 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  40.72 
 
 		 837 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  41.44 
 
 		 822 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  42.02 
 
 		 808 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  40.59 
 
 		 837 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  43.16 
 
 		 787 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  46.22 
 
 		 785 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  45.47 
 
 		 778 aa  465  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  44.49 
 
 		 812 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  45.13 
 
 		 764 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.51 
 
 		 817 aa  442  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  39.77 
 
 		 860 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  43.74 
 
 		 764 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  48.71 
 
 		 598 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.48 
 
 		 832 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  45.5 
 
 		 640 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.08 
 
 		 622 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  46.42 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.65 
 
 		 571 aa  336  7.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  35.54 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 927 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.75 
 
 		 894 aa  257  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.59 
 
 		 894 aa  251  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.06 
 
 		 930 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.84 
 
 		 930 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 		 898 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 		 930 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.76 
 
 		 887 aa  241  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.52 
 
 		 943 aa  237  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.97 
 
 		 900 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.46 
 
 		 864 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.55 
 
 		 938 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.8 
 
 		 905 aa  233  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  25.56 
 
 		 861 aa  230  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 930 aa  230  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.57 
 
 		 930 aa  230  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.97 
 
 		 930 aa  230  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  25.85 
 
 		 874 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 914 aa  229  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  28.01 
 
 		 936 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.46 
 
 		 924 aa  228  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  27.92 
 
 		 969 aa  227  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  25.57 
 
 		 857 aa  225  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  25.33 
 
 		 899 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 900 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.05 
 
 		 933 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  29.07 
 
 		 893 aa  220  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.09 
 
 		 870 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.32 
 
 		 931 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.07 
 
 		 933 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  25.84 
 
 		 937 aa  218  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 928 aa  218  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 900 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 900 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 928 aa  218  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  25.37 
 
 		 931 aa  218  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26.98 
 
 		 941 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  25.8 
 
 		 968 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.24 
 
 		 932 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  24.94 
 
 		 856 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  26.47 
 
 		 928 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  26.7 
 
 		 890 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  25.77 
 
 		 899 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  25.3 
 
 		 892 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.33 
 
 		 931 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 900 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  26.05 
 
 		 891 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  26.47 
 
 		 890 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  26.06 
 
 		 874 aa  214  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 890 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 890 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  25.49 
 
 		 851 aa  213  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  25.93 
 
 		 899 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.33 
 
 		 949 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  26.71 
 
 		 936 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  26.47 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  24.8 
 
 		 861 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  25.56 
 
 		 903 aa  211  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  26.41 
 
 		 900 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.14 
 
 		 931 aa  211  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  26.45 
 
 		 890 aa  210  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 		 953 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  26.39 
 
 		 881 aa  210  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.81 
 
 		 890 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 890 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  26.33 
 
 		 890 aa  209  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  24.89 
 
 		 861 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  25 
 
 		 859 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 890 aa  208  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 890 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  26.22 
 
 		 890 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 890 aa  208  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 935 aa  208  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>