238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4013 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 791 aa  1508    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  50.51 
 
 		 761 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.96 
 
 		 780 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  52.25 
 
 		 812 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  47.04 
 
 		 764 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  48.04 
 
 		 787 aa  514  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  43.31 
 
 		 837 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  43.31 
 
 		 837 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  43.17 
 
 		 837 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  42.8 
 
 		 824 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  49.86 
 
 		 785 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  47.45 
 
 		 771 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  42.8 
 
 		 822 aa  492  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  45.75 
 
 		 764 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  45.48 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  44.73 
 
 		 808 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  44.74 
 
 		 707 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.11 
 
 		 817 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  45.25 
 
 		 778 aa  433  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  42.26 
 
 		 860 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.2 
 
 		 832 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  46.44 
 
 		 598 aa  351  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  44.83 
 
 		 640 aa  350  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.22 
 
 		 622 aa  339  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 		 582 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.4 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  34.12 
 
 		 596 aa  280  9e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.28 
 
 		 887 aa  242  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.39 
 
 		 902 aa  237  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  28.69 
 
 		 943 aa  233  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 936 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.27 
 
 		 894 aa  230  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.11 
 
 		 930 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.11 
 
 		 930 aa  229  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  28.29 
 
 		 930 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.89 
 
 		 894 aa  227  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.21 
 
 		 899 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 		 927 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.6 
 
 		 931 aa  218  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  26.29 
 
 		 933 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 898 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 936 aa  213  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.2 
 
 		 933 aa  213  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  25.57 
 
 		 931 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.42 
 
 		 900 aa  210  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.37 
 
 		 924 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 930 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  26.97 
 
 		 969 aa  208  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  25.51 
 
 		 932 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.15 
 
 		 930 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  25.86 
 
 		 931 aa  207  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  25.62 
 
 		 925 aa  207  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.55 
 
 		 914 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.04 
 
 		 930 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  28.03 
 
 		 938 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.86 
 
 		 864 aa  203  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.21 
 
 		 949 aa  201  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.08 
 
 		 931 aa  201  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.76 
 
 		 905 aa  201  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.66 
 
 		 893 aa  201  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  27.39 
 
 		 912 aa  197  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 937 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.09 
 
 		 935 aa  193  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  24.85 
 
 		 941 aa  193  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  25.64 
 
 		 852 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  24.77 
 
 		 934 aa  191  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  24.97 
 
 		 906 aa  191  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  25.39 
 
 		 900 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  26.3 
 
 		 936 aa  190  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  26.24 
 
 		 1029 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  26.08 
 
 		 899 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  25.27 
 
 		 900 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  28.2 
 
 		 861 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  27.1 
 
 		 889 aa  188  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  25.69 
 
 		 892 aa  188  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  24.85 
 
 		 900 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  23.47 
 
 		 861 aa  187  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  27.13 
 
 		 941 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  25.06 
 
 		 857 aa  187  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  23.47 
 
 		 861 aa  187  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.39 
 
 		 900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  25.92 
 
 		 928 aa  185  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  27.16 
 
 		 862 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  25.92 
 
 		 928 aa  184  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  27.47 
 
 		 862 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  25.92 
 
 		 928 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  26.44 
 
 		 861 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  26.25 
 
 		 877 aa  182  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  24.58 
 
 		 968 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  26.41 
 
 		 861 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  24.21 
 
 		 968 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  25.14 
 
 		 934 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 856 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.24 
 
 		 900 aa  181  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 861 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  24.71 
 
 		 934 aa  180  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.09 
 
 		 863 aa  180  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  25.39 
 
 		 899 aa  180  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.96 
 
 		 862 aa  180  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>