239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6202 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  76.38 
 
 
785 aa  989    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  100 
 
 
812 aa  1555    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  52.25 
 
 
791 aa  547  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  52.77 
 
 
761 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  49.86 
 
 
780 aa  535  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  43.3 
 
 
837 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  43.3 
 
 
837 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  44.89 
 
 
822 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  43.3 
 
 
837 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  43.28 
 
 
824 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  46.66 
 
 
787 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  42.84 
 
 
860 aa  475  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  48.39 
 
 
764 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  43.62 
 
 
808 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  48.09 
 
 
771 aa  475  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  45.02 
 
 
786 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.24 
 
 
817 aa  452  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  45.11 
 
 
778 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  45.31 
 
 
764 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  42.94 
 
 
707 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.53 
 
 
832 aa  356  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  45.39 
 
 
640 aa  353  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  45.57 
 
 
598 aa  348  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.06 
 
 
622 aa  333  9e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 
582 aa  312  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.69 
 
 
571 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  34.68 
 
 
596 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.43 
 
 
894 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.43 
 
 
894 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  28.33 
 
 
902 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  27.31 
 
 
899 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  29.37 
 
 
930 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
898 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  29.43 
 
 
934 aa  244  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  28.82 
 
 
936 aa  243  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  29.3 
 
 
934 aa  243  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.07 
 
 
887 aa  239  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.94 
 
 
905 aa  237  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.31 
 
 
864 aa  236  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.78 
 
 
938 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  27.86 
 
 
934 aa  234  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.5 
 
 
914 aa  233  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.88 
 
 
930 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  27.54 
 
 
931 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.88 
 
 
930 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  29.65 
 
 
893 aa  230  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  28.15 
 
 
949 aa  230  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.65 
 
 
931 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.06 
 
 
900 aa  228  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  28.79 
 
 
943 aa  228  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  28.74 
 
 
931 aa  227  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  28.16 
 
 
931 aa  226  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.18 
 
 
933 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.95 
 
 
936 aa  223  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  26.42 
 
 
906 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  30.1 
 
 
912 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.46 
 
 
933 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.56 
 
 
924 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 
900 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.37 
 
 
968 aa  217  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.09 
 
 
932 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  27.85 
 
 
937 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  31.47 
 
 
969 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  28.5 
 
 
989 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  23.05 
 
 
861 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  23.3 
 
 
861 aa  211  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  29.4 
 
 
941 aa  210  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.66 
 
 
900 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 
900 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.94 
 
 
935 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 
900 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  30.7 
 
 
925 aa  208  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.59 
 
 
927 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  28 
 
 
935 aa  204  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.64 
 
 
930 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  29.6 
 
 
862 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.6 
 
 
862 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 
858 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.45 
 
 
899 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  27.31 
 
 
899 aa  202  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.54 
 
 
930 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  26.62 
 
 
898 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  25.77 
 
 
852 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  32.46 
 
 
850 aa  200  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  28.25 
 
 
953 aa  200  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.18 
 
 
930 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.17 
 
 
895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 
900 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 
899 aa  197  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  27.32 
 
 
858 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  27.32 
 
 
858 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  27.47 
 
 
858 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.94 
 
 
863 aa  196  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  27.6 
 
 
858 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>