251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7998 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 832 aa  1572    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  44.1 
 
 		 764 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  43.91 
 
 		 764 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  42.47 
 
 		 785 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  39.42 
 
 		 808 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  48.92 
 
 		 761 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  47.69 
 
 		 786 aa  360  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  47.56 
 
 		 780 aa  360  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.89 
 
 		 791 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 598 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  40.77 
 
 		 640 aa  333  8e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  46.42 
 
 		 771 aa  331  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  41.21 
 
 		 837 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  41.21 
 
 		 837 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  40.38 
 
 		 837 aa  320  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  43.97 
 
 		 812 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  46.75 
 
 		 707 aa  317  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  45.55 
 
 		 787 aa  316  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  39.83 
 
 		 778 aa  311  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  40.19 
 
 		 824 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  41.47 
 
 		 822 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 		 582 aa  303  6.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  38.74 
 
 		 860 aa  272  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.52 
 
 		 817 aa  258  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  28.9 
 
 		 943 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.61 
 
 		 894 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 933 aa  241  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.94 
 
 		 931 aa  239  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 		 932 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  30.22 
 
 		 938 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 928 aa  237  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  31.47 
 
 		 596 aa  237  7e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 928 aa  237  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  26.43 
 
 		 925 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.24 
 
 		 931 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.93 
 
 		 931 aa  234  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  27.36 
 
 		 949 aa  233  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.44 
 
 		 914 aa  229  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.89 
 
 		 924 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 931 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  26.23 
 
 		 968 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  26.56 
 
 		 891 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  27.46 
 
 		 903 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.44 
 
 		 864 aa  224  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  25.78 
 
 		 968 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  27.78 
 
 		 904 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.95 
 
 		 930 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.95 
 
 		 930 aa  221  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  27.39 
 
 		 890 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.6 
 
 		 936 aa  219  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 892 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  25 
 
 		 934 aa  217  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.57 
 
 		 887 aa  217  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.76 
 
 		 930 aa  217  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  26.29 
 
 		 900 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  25 
 
 		 934 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.88 
 
 		 900 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  27.64 
 
 		 890 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  27.21 
 
 		 890 aa  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  27.52 
 
 		 890 aa  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  26.15 
 
 		 890 aa  214  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  27.52 
 
 		 890 aa  214  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  27.52 
 
 		 890 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  25.77 
 
 		 900 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.99 
 
 		 900 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 890 aa  213  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  25.58 
 
 		 912 aa  213  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 890 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.56 
 
 		 890 aa  213  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  26.03 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 890 aa  212  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.34 
 
 		 902 aa  211  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  25.95 
 
 		 933 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  25.48 
 
 		 900 aa  211  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  25.92 
 
 		 890 aa  210  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  28.85 
 
 		 941 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  24.63 
 
 		 883 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  25.92 
 
 		 890 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  26.54 
 
 		 937 aa  209  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.17 
 
 		 622 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.41 
 
 		 900 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.17 
 
 		 936 aa  207  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  26.02 
 
 		 874 aa  207  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  25.9 
 
 		 859 aa  206  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  27.41 
 
 		 857 aa  205  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  27.11 
 
 		 893 aa  201  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  29.2 
 
 		 852 aa  201  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  24.62 
 
 		 899 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 953 aa  197  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  25.59 
 
 		 874 aa  197  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.49 
 
 		 882 aa  196  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  25.23 
 
 		 898 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  26.53 
 
 		 858 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  26.53 
 
 		 858 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  26.71 
 
 		 859 aa  194  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  26.64 
 
 		 858 aa  194  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.69 
 
 		 934 aa  192  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>