223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1234 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  100 
 
 		 596 aa  1219    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  43.38 
 
 		 598 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  43.05 
 
 		 640 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.45 
 
 		 622 aa  422  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.68 
 
 		 571 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.42 
 
 		 582 aa  357  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  38.66 
 
 		 778 aa  334  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  38.6 
 
 		 707 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  36.95 
 
 		 786 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.11 
 
 		 761 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  35.55 
 
 		 785 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  34.43 
 
 		 787 aa  250  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  31.21 
 
 		 837 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  31.21 
 
 		 837 aa  250  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.43 
 
 		 791 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  32.62 
 
 		 808 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  31.03 
 
 		 837 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  34.05 
 
 		 764 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 		 764 aa  240  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.09 
 
 		 780 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  32.08 
 
 		 824 aa  236  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  33.8 
 
 		 812 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.96 
 
 		 817 aa  234  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.36 
 
 		 832 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  31.72 
 
 		 822 aa  232  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  33.52 
 
 		 860 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  32.64 
 
 		 771 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  25.4 
 
 		 902 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  24.12 
 
 		 968 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  23.25 
 
 		 899 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.63 
 
 		 894 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.01 
 
 		 900 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.68 
 
 		 894 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 		 897 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  23.83 
 
 		 900 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  22.4 
 
 		 905 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.1 
 
 		 900 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  23.75 
 
 		 968 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 900 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.21 
 
 		 900 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  24.53 
 
 		 899 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  24.84 
 
 		 930 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  25.94 
 
 		 900 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  24.84 
 
 		 930 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 		 898 aa  127  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.49 
 
 		 864 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  22.99 
 
 		 941 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  27.21 
 
 		 875 aa  123  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  24.19 
 
 		 949 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  23.8 
 
 		 914 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  23.93 
 
 		 930 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  24.11 
 
 		 943 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  26.28 
 
 		 891 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  24.58 
 
 		 941 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  24.62 
 
 		 899 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  23.33 
 
 		 887 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  24.71 
 
 		 858 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  24.01 
 
 		 900 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  23.3 
 
 		 906 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  24.84 
 
 		 891 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  24.5 
 
 		 898 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  22.52 
 
 		 869 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  23.82 
 
 		 890 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  23.82 
 
 		 890 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  23.82 
 
 		 890 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  23.79 
 
 		 934 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  23.82 
 
 		 890 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  23.1 
 
 		 931 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.65 
 
 		 870 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.54 
 
 		 936 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  23.37 
 
 		 933 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  23.66 
 
 		 890 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  23.75 
 
 		 858 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  23.26 
 
 		 861 aa  114  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  24.26 
 
 		 858 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  23.47 
 
 		 852 aa  113  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  23.26 
 
 		 861 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  23.51 
 
 		 858 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  22.2 
 
 		 924 aa  113  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  23.83 
 
 		 893 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  24.4 
 
 		 859 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  23.56 
 
 		 883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  23.92 
 
 		 900 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  23.83 
 
 		 858 aa  112  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  24.18 
 
 		 858 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  23.56 
 
 		 859 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  23.24 
 
 		 890 aa  111  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  23.87 
 
 		 858 aa  111  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  23.93 
 
 		 858 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  23.93 
 
 		 858 aa  111  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  26.66 
 
 		 850 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  22.93 
 
 		 892 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  23.44 
 
 		 893 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>