237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2384 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  64.22 
 
 		 900 aa  1177    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  72.44 
 
 		 902 aa  1372    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  49.1 
 
 		 906 aa  884    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  74.3 
 
 		 899 aa  1408    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  70.17 
 
 		 894 aa  1312    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  63.41 
 
 		 905 aa  1164    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  71.06 
 
 		 894 aa  1323    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 898 aa  1842    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  38.15 
 
 		 924 aa  604  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 		 927 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.38 
 
 		 930 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.16 
 
 		 930 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  34.04 
 
 		 930 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  34.79 
 
 		 931 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  35.48 
 
 		 936 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  33.84 
 
 		 930 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  33.92 
 
 		 930 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  33.84 
 
 		 930 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  32.38 
 
 		 935 aa  482  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  35.32 
 
 		 893 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  34.03 
 
 		 936 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  33.7 
 
 		 934 aa  475  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  33.74 
 
 		 943 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.25 
 
 		 864 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
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NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  33.93 
 
 		 934 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  31.83 
 
 		 936 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  32.83 
 
 		 928 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  33.97 
 
 		 934 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 914 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
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NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.76 
 
 		 887 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 938 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  32.71 
 
 		 928 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
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NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  32.48 
 
 		 928 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  31.44 
 
 		 1029 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  32.63 
 
 		 941 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  31.94 
 
 		 933 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  31.6 
 
 		 912 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  32.1 
 
 		 953 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  32.22 
 
 		 933 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
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NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  33.14 
 
 		 937 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 		 935 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
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NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  32.34 
 
 		 932 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
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NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  32 
 
 		 931 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  33.22 
 
 		 949 aa  442  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
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NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  32.07 
 
 		 931 aa  439  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  31.72 
 
 		 925 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  31.7 
 
 		 931 aa  436  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
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NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  32.74 
 
 		 968 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
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NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  31.48 
 
 		 969 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  32.41 
 
 		 968 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  32.69 
 
 		 899 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.86 
 
 		 937 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
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NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  32.03 
 
 		 941 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  31.38 
 
 		 912 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.31 
 
 		 894 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.94 
 
 		 893 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  31.32 
 
 		 989 aa  402  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.25 
 
 		 869 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  30.75 
 
 		 900 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  31.2 
 
 		 899 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  30.72 
 
 		 892 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  31.51 
 
 		 895 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 889 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  31.15 
 
 		 900 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  30.63 
 
 		 900 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  31.62 
 
 		 885 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.97 
 
 		 916 aa  396  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  30.03 
 
 		 899 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  30.56 
 
 		 900 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  31.68 
 
 		 898 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  30.78 
 
 		 852 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  30.62 
 
 		 900 aa  389  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  31.01 
 
 		 890 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  31.74 
 
 		 897 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  29.8 
 
 		 884 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 900 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  29.12 
 
 		 900 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  30.28 
 
 		 877 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  31.67 
 
 		 884 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  30.8 
 
 		 859 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  29.75 
 
 		 858 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  29.65 
 
 		 888 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  29.85 
 
 		 858 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  29.89 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  29.6 
 
 		 858 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  29.77 
 
 		 858 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  29.85 
 
 		 858 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  31.79 
 
 		 884 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 875 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  29.85 
 
 		 858 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  28.85 
 
 		 900 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  30.43 
 
 		 859 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  31.05 
 
 		 857 aa  379  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  30.4 
 
 		 893 aa  378  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  29.68 
 
 		 895 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  31.36 
 
 		 904 aa  379  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  31.14 
 
 		 861 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  30.81 
 
 		 898 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  31.09 
 
 		 862 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  31.19 
 
 		 903 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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