226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1918 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  59.42 
 
 		 861 aa  1017    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  58.48 
 
 		 858 aa  1005    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  59.55 
 
 		 858 aa  1030    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  59.83 
 
 		 862 aa  1009    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  64.9 
 
 		 868 aa  1162    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  49.41 
 
 		 852 aa  828    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  61.12 
 
 		 869 aa  1052    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  48.83 
 
 		 850 aa  774    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  59.67 
 
 		 858 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  58.5 
 
 		 858 aa  1011    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  58.13 
 
 		 858 aa  1000    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  47.56 
 
 		 887 aa  787    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  59.41 
 
 		 859 aa  1030    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  59.67 
 
 		 858 aa  1031    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  60.07 
 
 		 862 aa  1010    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2422  PII uridylyl-transferase  63.54 
 
 		 863 aa  1133    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  59.21 
 
 		 858 aa  1019    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  47.48 
 
 		 856 aa  778    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2588  PII uridylyl-transferase  65.51 
 
 		 863 aa  1144    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.510321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  58.59 
 
 		 859 aa  1025    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  52.09 
 
 		 858 aa  846    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  60.25 
 
 		 857 aa  1045    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  58.6 
 
 		 858 aa  1007    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  58.87 
 
 		 859 aa  1016    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  58.38 
 
 		 858 aa  1008    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  58.6 
 
 		 858 aa  1007    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  65.78 
 
 		 884 aa  1149    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  65.23 
 
 		 895 aa  1099    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 884 aa  1814    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  64.43 
 
 		 885 aa  1127    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1819  PII uridylyl-transferase  64.35 
 
 		 864 aa  1132    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  65.78 
 
 		 884 aa  1148    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  59.67 
 
 		 858 aa  1031    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3611  PII uridylyl-transferase  63.76 
 
 		 893 aa  1107    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434009  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  74.56 
 
 		 875 aa  1316    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  59.67 
 
 		 858 aa  1031    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  59.67 
 
 		 858 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  59.79 
 
 		 858 aa  1034    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  59.67 
 
 		 858 aa  1031    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  53.26 
 
 		 865 aa  946    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.42 
 
 		 893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.91 
 
 		 894 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  40.5 
 
 		 889 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  38.52 
 
 		 900 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  38.41 
 
 		 900 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  38.69 
 
 		 900 aa  572  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  39.49 
 
 		 899 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  39.48 
 
 		 892 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  38.13 
 
 		 899 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  38.71 
 
 		 900 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  38.83 
 
 		 900 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  38.48 
 
 		 900 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  38.26 
 
 		 898 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  38.93 
 
 		 899 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  38.48 
 
 		 900 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  37.97 
 
 		 877 aa  539  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  37.49 
 
 		 898 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  37.9 
 
 		 900 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  36.31 
 
 		 874 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 		 897 aa  529  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  36.57 
 
 		 881 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  36.42 
 
 		 888 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  38.42 
 
 		 891 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.08 
 
 		 869 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  37.65 
 
 		 890 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.77 
 
 		 890 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  37.65 
 
 		 890 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  37.65 
 
 		 890 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  37.11 
 
 		 857 aa  515  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  38 
 
 		 856 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  37.65 
 
 		 890 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  37.65 
 
 		 890 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  36.47 
 
 		 874 aa  512  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  37.41 
 
 		 890 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  37.53 
 
 		 890 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  37.53 
 
 		 890 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  37.93 
 
 		 903 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  37.8 
 
 		 904 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  37.07 
 
 		 890 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  35.13 
 
 		 861 aa  505  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  36.29 
 
 		 893 aa  505  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  37.25 
 
 		 857 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  37.7 
 
 		 893 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  37.7 
 
 		 912 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  37.86 
 
 		 861 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  37.63 
 
 		 861 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  37.7 
 
 		 893 aa  501  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  37.44 
 
 		 860 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  37.34 
 
 		 861 aa  499  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  36 
 
 		 859 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  37.51 
 
 		 861 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  37.4 
 
 		 861 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  37.75 
 
 		 861 aa  499  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  37.75 
 
 		 861 aa  499  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  37.71 
 
 		 892 aa  497  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
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