228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1499 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  43.2 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.08 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  42.96 
 
 		 892 aa  673    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  45.9 
 
 		 900 aa  767    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  48.1 
 
 		 877 aa  770    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  42.16 
 
 		 878 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  43.2 
 
 		 890 aa  677    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  46.24 
 
 		 861 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  46.12 
 
 		 898 aa  754    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  40.86 
 
 		 861 aa  651    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  40.98 
 
 		 861 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  45.38 
 
 		 898 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  41.07 
 
 		 915 aa  644    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  43.76 
 
 		 852 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  41.05 
 
 		 874 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  44.31 
 
 		 851 aa  684    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  47.87 
 
 		 892 aa  791    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  46.13 
 
 		 900 aa  764    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  58.76 
 
 		 899 aa  975    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  41.72 
 
 		 893 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  43.2 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  45.87 
 
 		 861 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  43.16 
 
 		 888 aa  684    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  44.27 
 
 		 859 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  46.02 
 
 		 899 aa  777    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  45.19 
 
 		 859 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  41.75 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  43.2 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  44.29 
 
 		 900 aa  736    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  41.67 
 
 		 890 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  42.36 
 
 		 856 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  42.55 
 
 		 904 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  44.87 
 
 		 861 aa  718    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  41.2 
 
 		 883 aa  690    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  41.72 
 
 		 912 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  47.93 
 
 		 891 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  45.9 
 
 		 900 aa  763    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  41.19 
 
 		 913 aa  645    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  44.25 
 
 		 903 aa  691    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  46.61 
 
 		 900 aa  778    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  43.03 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  41.65 
 
 		 899 aa  652    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.79 
 
 		 870 aa  643    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  41.67 
 
 		 890 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  47.71 
 
 		 899 aa  798    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  46.36 
 
 		 861 aa  707    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  46.24 
 
 		 861 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  53.99 
 
 		 894 aa  887    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  41.67 
 
 		 890 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  45.38 
 
 		 857 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  40.58 
 
 		 874 aa  691    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  46.61 
 
 		 900 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  45.9 
 
 		 900 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  41.72 
 
 		 893 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  41.67 
 
 		 890 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  46 
 
 		 861 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  46.06 
 
 		 860 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  42.84 
 
 		 891 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  43.08 
 
 		 890 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  41.55 
 
 		 890 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  43.2 
 
 		 890 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  45.97 
 
 		 856 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 		 897 aa  730    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.77 
 
 		 869 aa  658    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  44.48 
 
 		 881 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  45.75 
 
 		 861 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  43.48 
 
 		 890 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  44.15 
 
 		 893 aa  679    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  53.57 
 
 		 889 aa  840    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 893 aa  1809    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  45.87 
 
 		 861 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  44.13 
 
 		 857 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  45.93 
 
 		 900 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  45.87 
 
 		 861 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  40.81 
 
 		 881 aa  693    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  42 
 
 		 859 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  42 
 
 		 859 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  42.77 
 
 		 858 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  41.82 
 
 		 887 aa  618  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.4 
 
 		 863 aa  614  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  40.96 
 
 		 858 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  41.49 
 
 		 859 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  40.33 
 
 		 858 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  40.33 
 
 		 858 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  40.33 
 
 		 858 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  42.59 
 
 		 850 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  40.33 
 
 		 858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  40.42 
 
 		 884 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  40.45 
 
 		 858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  40.45 
 
 		 858 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  40.6 
 
 		 858 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  40.3 
 
 		 861 aa  601  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  41.08 
 
 		 862 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  40.48 
 
 		 862 aa  602  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
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