226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2942 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  62.41 
 
 		 861 aa  1050    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  59.39 
 
 		 858 aa  1014    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  60.74 
 
 		 858 aa  1011    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 868 aa  1779    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  70.57 
 
 		 884 aa  1233    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  50.93 
 
 		 852 aa  855    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  60.6 
 
 		 869 aa  1046    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  49.05 
 
 		 850 aa  772    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  64.9 
 
 		 884 aa  1162    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  60.62 
 
 		 858 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  59.98 
 
 		 858 aa  1023    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  47.03 
 
 		 887 aa  779    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  59.81 
 
 		 858 aa  1008    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  59.17 
 
 		 859 aa  1015    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2422  PII uridylyl-transferase  72.5 
 
 		 863 aa  1296    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  49.69 
 
 		 856 aa  794    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2588  PII uridylyl-transferase  71.69 
 
 		 863 aa  1264    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.510321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  59.25 
 
 		 859 aa  1010    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  59.19 
 
 		 859 aa  1010    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  59.79 
 
 		 857 aa  1032    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  59.86 
 
 		 858 aa  1022    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  59.28 
 
 		 858 aa  1013    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  59.86 
 
 		 858 aa  1022    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  59.98 
 
 		 858 aa  1014    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  49.36 
 
 		 858 aa  794    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  68.05 
 
 		 895 aa  1165    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  62.03 
 
 		 862 aa  1021    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  62.27 
 
 		 862 aa  1023    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  70.69 
 
 		 885 aa  1239    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1819  PII uridylyl-transferase  69.59 
 
 		 864 aa  1239    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  70.46 
 
 		 884 aa  1231    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  60.62 
 
 		 858 aa  1009    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3611  PII uridylyl-transferase  70.08 
 
 		 893 aa  1208    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434009  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1759  PII uridylyl-transferase  64.86 
 
 		 875 aa  1135    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.308233 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  60.62 
 
 		 858 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  59.74 
 
 		 858 aa  1019    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  60.62 
 
 		 858 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  60.62 
 
 		 858 aa  1009    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  60.62 
 
 		 858 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  54.94 
 
 		 865 aa  969    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.89 
 
 		 894 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  40.57 
 
 		 892 aa  579  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  39.54 
 
 		 900 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.29 
 
 		 893 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  39.64 
 
 		 900 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 		 889 aa  571  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  39.81 
 
 		 899 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  39.04 
 
 		 900 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
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NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  38.88 
 
 		 900 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  38.7 
 
 		 899 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  39 
 
 		 900 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  39.4 
 
 		 900 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  38.76 
 
 		 900 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  37.57 
 
 		 899 aa  555  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  38.79 
 
 		 877 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  37.62 
 
 		 898 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  37.73 
 
 		 900 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  37.15 
 
 		 897 aa  532  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
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NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  37.9 
 
 		 857 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  37.14 
 
 		 898 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.52 
 
 		 890 aa  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  36.29 
 
 		 890 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  36.29 
 
 		 890 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  515  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  36.41 
 
 		 890 aa  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  36.56 
 
 		 890 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  36.41 
 
 		 890 aa  516  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  36.27 
 
 		 890 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  35.76 
 
 		 861 aa  511  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  36.27 
 
 		 890 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  37.03 
 
 		 904 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  36.27 
 
 		 890 aa  509  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  36.27 
 
 		 890 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  37.03 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  36.34 
 
 		 890 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  37.63 
 
 		 856 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  37.05 
 
 		 892 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  36.64 
 
 		 893 aa  505  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  35.85 
 
 		 874 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  36.73 
 
 		 890 aa  502  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  35.89 
 
 		 888 aa  500  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  38.15 
 
 		 891 aa  501  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  36.07 
 
 		 881 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  36.73 
 
 		 912 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  36.73 
 
 		 893 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  36.73 
 
 		 893 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  35.88 
 
 		 859 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  35.57 
 
 		 891 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  34.9 
 
 		 878 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  35.63 
 
 		 874 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  36.89 
 
 		 857 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  36.74 
 
 		 899 aa  488  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  35.63 
 
 		 915 aa  484  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  37.94 
 
 		 851 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.22 
 
 		 869 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  37.82 
 
 		 861 aa  479  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  36.77 
 
 		 861 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  36.89 
 
 		 860 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
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