239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3155 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 916 aa  1823    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
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NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.21 
 
 		 894 aa  426  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.59 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.77 
 
 		 894 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.27 
 
 		 930 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 		 930 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  32.84 
 
 		 902 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  31.89 
 
 		 899 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  35.6 
 
 		 927 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
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NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 898 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.74 
 
 		 900 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.18 
 
 		 905 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  30.8 
 
 		 906 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  31.01 
 
 		 968 aa  348  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
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NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  32.38 
 
 		 936 aa  347  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  31.07 
 
 		 941 aa  346  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  30.82 
 
 		 931 aa  340  8e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  31.24 
 
 		 938 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  31.3 
 
 		 930 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  31.19 
 
 		 930 aa  332  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  31.34 
 
 		 949 aa  330  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.69 
 
 		 924 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  31.17 
 
 		 936 aa  327  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  30.45 
 
 		 930 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  30.44 
 
 		 931 aa  318  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
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NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  30.11 
 
 		 934 aa  317  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  31.03 
 
 		 928 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
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NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  31.03 
 
 		 928 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  29.01 
 
 		 914 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
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NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.21 
 
 		 864 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
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NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  30.2 
 
 		 934 aa  315  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  30.26 
 
 		 928 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
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NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  30.23 
 
 		 934 aa  313  7.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  34.25 
 
 		 968 aa  313  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
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NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  29.78 
 
 		 931 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  29.06 
 
 		 943 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  30.65 
 
 		 935 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
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NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  30.23 
 
 		 1029 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  30.04 
 
 		 933 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  28.46 
 
 		 900 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  30.72 
 
 		 969 aa  307  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  30.09 
 
 		 935 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
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NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  30.22 
 
 		 932 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
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NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  28.35 
 
 		 900 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  30.92 
 
 		 895 aa  303  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  28.05 
 
 		 898 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 899 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  30.18 
 
 		 931 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  30.23 
 
 		 937 aa  301  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  30.78 
 
 		 936 aa  301  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  30 
 
 		 933 aa  301  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 899 aa  299  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.44 
 
 		 912 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  31.91 
 
 		 941 aa  299  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  30.87 
 
 		 953 aa  298  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  28.04 
 
 		 900 aa  297  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  28.04 
 
 		 900 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  27.66 
 
 		 881 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  27.74 
 
 		 900 aa  294  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
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NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  29.49 
 
 		 884 aa  293  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
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NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  29.63 
 
 		 925 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  27.7 
 
 		 900 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  29.21 
 
 		 899 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  26.16 
 
 		 861 aa  290  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  26.16 
 
 		 861 aa  290  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  29.61 
 
 		 862 aa  289  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  27.55 
 
 		 900 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 989 aa  288  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  33.04 
 
 		 893 aa  286  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  29.36 
 
 		 858 aa  287  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  29.63 
 
 		 858 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.57 
 
 		 937 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2422  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 863 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  30.01 
 
 		 861 aa  282  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  29.65 
 
 		 858 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  29.42 
 
 		 862 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  30.27 
 
 		 884 aa  281  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  30.27 
 
 		 884 aa  281  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  29.73 
 
 		 858 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  27.61 
 
 		 898 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  31.48 
 
 		 862 aa  280  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.48 
 
 		 862 aa  280  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  29.49 
 
 		 858 aa  280  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  29.44 
 
 		 858 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  29.6 
 
 		 858 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  32.59 
 
 		 912 aa  278  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  29.6 
 
 		 858 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  29.76 
 
 		 885 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  28.22 
 
 		 859 aa  277  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  27.84 
 
 		 852 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 858 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 858 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 858 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 858 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 858 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 858 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.03 
 
 		 893 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
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NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  28.73 
 
 		 895 aa  275  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  27.24 
 
 		 900 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.41 
 
 		 869 aa  275  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
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