236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0567 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 887 aa  1819    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.9 
 
 		 894 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  35.55 
 
 		 902 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.58 
 
 		 894 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  34.03 
 
 		 899 aa  475  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 		 898 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.73 
 
 		 900 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.71 
 
 		 864 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  36.14 
 
 		 906 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.34 
 
 		 967 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.96 
 
 		 905 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  33.7 
 
 		 936 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  33.14 
 
 		 930 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  33.57 
 
 		 872 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.54 
 
 		 924 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  32.11 
 
 		 943 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.77 
 
 		 833 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  32.91 
 
 		 930 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  33.13 
 
 		 936 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  33.08 
 
 		 893 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  32.91 
 
 		 930 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  32.57 
 
 		 912 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 968 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  32.46 
 
 		 934 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  30.83 
 
 		 906 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  32.22 
 
 		 968 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 935 aa  379  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.07 
 
 		 930 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.07 
 
 		 930 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  30.68 
 
 		 931 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  33.62 
 
 		 941 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  31.99 
 
 		 934 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  31.99 
 
 		 934 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  31.87 
 
 		 930 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  31.13 
 
 		 914 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 		 927 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  33.61 
 
 		 938 aa  361  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  31.76 
 
 		 937 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  30.57 
 
 		 931 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  32.48 
 
 		 949 aa  356  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  31.06 
 
 		 933 aa  354  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  31.21 
 
 		 933 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  30.04 
 
 		 912 aa  353  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  31.59 
 
 		 1029 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 935 aa  349  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  31.73 
 
 		 936 aa  350  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  31.29 
 
 		 969 aa  347  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  31.74 
 
 		 928 aa  346  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  30.74 
 
 		 932 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  31.59 
 
 		 928 aa  345  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  31.59 
 
 		 928 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  31.25 
 
 		 941 aa  344  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  31.44 
 
 		 953 aa  344  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.91 
 
 		 937 aa  344  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  30.41 
 
 		 931 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  30.73 
 
 		 925 aa  340  9e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  29.99 
 
 		 931 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  30.08 
 
 		 899 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  28.69 
 
 		 900 aa  324  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  30.75 
 
 		 877 aa  320  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  29.57 
 
 		 892 aa  320  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  30.23 
 
 		 859 aa  318  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  30.22 
 
 		 859 aa  317  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  30.92 
 
 		 858 aa  317  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  29.68 
 
 		 858 aa  317  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.95 
 
 		 893 aa  317  9e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  30.92 
 
 		 858 aa  317  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  30.23 
 
 		 859 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  31.89 
 
 		 899 aa  314  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  29.33 
 
 		 852 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  30.68 
 
 		 858 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  30.68 
 
 		 858 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  28.93 
 
 		 850 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  29.77 
 
 		 900 aa  311  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  29.53 
 
 		 900 aa  311  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  29.76 
 
 		 858 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  30.09 
 
 		 858 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  30.56 
 
 		 858 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  30.05 
 
 		 858 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 897 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  30.02 
 
 		 885 aa  309  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  30.05 
 
 		 858 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  30.05 
 
 		 858 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  30.05 
 
 		 858 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  30.05 
 
 		 858 aa  308  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  30.05 
 
 		 858 aa  308  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  28.16 
 
 		 895 aa  306  8.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  29.93 
 
 		 858 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  29.95 
 
 		 895 aa  306  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  29.92 
 
 		 858 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  28.69 
 
 		 862 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  28.86 
 
 		 881 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  29.61 
 
 		 900 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.38 
 
 		 869 aa  304  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0485  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 864 aa  304  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0747681  normal  0.0698071 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2422  PII uridylyl-transferase  30.41 
 
 		 863 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  30.22 
 
 		 884 aa  302  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.4 
 
 		 894 aa  302  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 889 aa  302  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2942  PII uridylyl-transferase  28.8 
 
 		 868 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>