232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0300 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  42.02 
 
 		 934 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  44.3 
 
 		 936 aa  731    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  41.82 
 
 		 934 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 		 931 aa  719    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  60.35 
 
 		 938 aa  1144    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 989 aa  2005    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  41.91 
 
 		 934 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  39.31 
 
 		 931 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  41.43 
 
 		 912 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  39.98 
 
 		 933 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  39.49 
 
 		 933 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  40.38 
 
 		 937 aa  623  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  40.48 
 
 		 925 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  40.11 
 
 		 932 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  41.58 
 
 		 935 aa  625  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  39.93 
 
 		 931 aa  619  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  40.43 
 
 		 936 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  39.85 
 
 		 949 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  39.15 
 
 		 931 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  40.13 
 
 		 912 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  40.76 
 
 		 935 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  39.93 
 
 		 928 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  40.29 
 
 		 928 aa  602  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  40.45 
 
 		 928 aa  601  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  38.88 
 
 		 1029 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  41.16 
 
 		 969 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  37.9 
 
 		 930 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  38.19 
 
 		 936 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  36.92 
 
 		 943 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  39.28 
 
 		 930 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  39.07 
 
 		 930 aa  582  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  39.39 
 
 		 941 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  38.9 
 
 		 968 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  38.67 
 
 		 953 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  38.26 
 
 		 893 aa  572  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  38.29 
 
 		 968 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  36.37 
 
 		 914 aa  561  1e-158  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  37.04 
 
 		 941 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.51 
 
 		 924 aa  535  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.17 
 
 		 936 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.26 
 
 		 894 aa  459  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  32.93 
 
 		 902 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  32.09 
 
 		 899 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.11 
 
 		 894 aa  452  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.97 
 
 		 899 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.49 
 
 		 905 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.57 
 
 		 893 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  31.38 
 
 		 906 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 		 898 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  32.86 
 
 		 899 aa  416  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 927 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.28 
 
 		 900 aa  412  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  32.72 
 
 		 881 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  31.17 
 
 		 900 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 859 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  33.06 
 
 		 877 aa  406  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  32.48 
 
 		 858 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  32.61 
 
 		 852 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  32.15 
 
 		 869 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 859 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  31.93 
 
 		 900 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  32.14 
 
 		 900 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  31.93 
 
 		 859 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 858 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 858 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  32.98 
 
 		 874 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  32.44 
 
 		 858 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 858 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  32.44 
 
 		 858 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  30.93 
 
 		 900 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  31.51 
 
 		 874 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  30.92 
 
 		 900 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  32.24 
 
 		 857 aa  399  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  30.93 
 
 		 900 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  32.87 
 
 		 858 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  33.6 
 
 		 858 aa  396  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  31.16 
 
 		 900 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  31.39 
 
 		 899 aa  395  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 858 aa  396  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.56 
 
 		 894 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 858 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  31.78 
 
 		 858 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  32.14 
 
 		 904 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  32.76 
 
 		 861 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  31.03 
 
 		 898 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  32.15 
 
 		 887 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  32.71 
 
 		 891 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  32.34 
 
 		 903 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  32.11 
 
 		 857 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  32.26 
 
 		 862 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 850 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  32.32 
 
 		 862 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  31.54 
 
 		 881 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  32.51 
 
 		 890 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  32.16 
 
 		 893 aa  383  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>