241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0911 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 869 aa  1759    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  32.64 
 
 		 906 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  32.35 
 
 		 902 aa  426  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  31.36 
 
 		 899 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.66 
 
 		 894 aa  422  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.59 
 
 		 894 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 898 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  29.01 
 
 		 943 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  30.55 
 
 		 931 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.9 
 
 		 900 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  29.81 
 
 		 930 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.18 
 
 		 905 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  29 
 
 		 930 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  29 
 
 		 930 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 936 aa  360  9e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  29.11 
 
 		 914 aa  359  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.89 
 
 		 936 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 934 aa  352  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  28.26 
 
 		 1029 aa  350  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 934 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  27.85 
 
 		 935 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  29.21 
 
 		 934 aa  347  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  27.97 
 
 		 928 aa  347  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  27.57 
 
 		 925 aa  346  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  30.18 
 
 		 937 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 936 aa  346  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  27.72 
 
 		 928 aa  345  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  29.85 
 
 		 949 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  27.81 
 
 		 928 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 927 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  28.76 
 
 		 893 aa  342  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  27.2 
 
 		 931 aa  339  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  30.31 
 
 		 953 aa  338  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  29.05 
 
 		 968 aa  336  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.3 
 
 		 933 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.27 
 
 		 931 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28.7 
 
 		 969 aa  334  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  28.45 
 
 		 968 aa  333  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 		 912 aa  331  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 		 930 aa  330  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.67 
 
 		 932 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.98 
 
 		 930 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  27.55 
 
 		 931 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  27.65 
 
 		 935 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  28.93 
 
 		 941 aa  326  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.23 
 
 		 933 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.27 
 
 		 930 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.64 
 
 		 924 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.47 
 
 		 912 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.38 
 
 		 887 aa  317  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  27.25 
 
 		 941 aa  316  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.91 
 
 		 864 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  26.04 
 
 		 895 aa  306  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 900 aa  297  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  26.97 
 
 		 899 aa  296  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.03 
 
 		 899 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.7 
 
 		 900 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  26.95 
 
 		 900 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  25.76 
 
 		 900 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 		 900 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 		 900 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  27.09 
 
 		 877 aa  288  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  25.5 
 
 		 938 aa  287  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  27.86 
 
 		 874 aa  286  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  27.58 
 
 		 881 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  28.05 
 
 		 883 aa  283  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  25.4 
 
 		 900 aa  283  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  27.51 
 
 		 874 aa  282  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.75 
 
 		 936 aa  282  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  26.77 
 
 		 891 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  26.14 
 
 		 900 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.9 
 
 		 916 aa  273  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.67 
 
 		 937 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 897 aa  272  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  25.23 
 
 		 852 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  25.61 
 
 		 859 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  25.62 
 
 		 859 aa  271  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  24.54 
 
 		 899 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  24.62 
 
 		 859 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  27.33 
 
 		 904 aa  270  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  26.25 
 
 		 898 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  24.97 
 
 		 857 aa  269  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 881 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  26.4 
 
 		 890 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.09 
 
 		 894 aa  267  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  24.83 
 
 		 858 aa  267  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  24.4 
 
 		 858 aa  266  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  25.67 
 
 		 892 aa  266  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  24.83 
 
 		 858 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  26.01 
 
 		 884 aa  266  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  24.57 
 
 		 858 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  25.03 
 
 		 858 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  25.03 
 
 		 858 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  25.03 
 
 		 858 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  26.49 
 
 		 865 aa  263  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.51 
 
 		 893 aa  263  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  26.96 
 
 		 903 aa  263  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  25.06 
 
 		 850 aa  261  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.11 
 
 		 862 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  26.11 
 
 		 862 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>