235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0574 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 864 aa  1766    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  35.84 
 
 		 899 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  36.71 
 
 		 902 aa  485  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.08 
 
 		 894 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 		 898 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.96 
 
 		 894 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.71 
 
 		 887 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.63 
 
 		 905 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.9 
 
 		 900 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  35.37 
 
 		 906 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  33.13 
 
 		 931 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  33.18 
 
 		 934 aa  415  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 930 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 930 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 930 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  31.75 
 
 		 934 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  33.98 
 
 		 969 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  33.82 
 
 		 968 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  32.74 
 
 		 935 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  31.64 
 
 		 934 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  32.09 
 
 		 925 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.88 
 
 		 924 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  33.53 
 
 		 949 aa  399  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  32.7 
 
 		 937 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  33.17 
 
 		 912 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  33.66 
 
 		 968 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 936 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  31.68 
 
 		 931 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  32.92 
 
 		 936 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  31.51 
 
 		 931 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  34.59 
 
 		 935 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  32.89 
 
 		 928 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  32.61 
 
 		 928 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  32.61 
 
 		 928 aa  386  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  31.92 
 
 		 932 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  32.04 
 
 		 933 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  31.11 
 
 		 912 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  32.16 
 
 		 933 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  32.61 
 
 		 872 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  31.55 
 
 		 943 aa  383  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  31.88 
 
 		 931 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
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NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  32.16 
 
 		 936 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  31.36 
 
 		 1029 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  32.68 
 
 		 941 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.73 
 
 		 930 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  32.45 
 
 		 893 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 927 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  31.62 
 
 		 941 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  31.84 
 
 		 930 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  30.6 
 
 		 914 aa  373  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  31.23 
 
 		 938 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.29 
 
 		 930 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  32.04 
 
 		 953 aa  361  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  31.26 
 
 		 906 aa  352  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.45 
 
 		 967 aa  343  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
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NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  31.52 
 
 		 895 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  32.16 
 
 		 899 aa  337  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.83 
 
 		 890 aa  330  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  29.8 
 
 		 890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  29.8 
 
 		 890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  29.8 
 
 		 890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  29.8 
 
 		 890 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  29.89 
 
 		 890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  29.89 
 
 		 890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  28.5 
 
 		 900 aa  328  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.2 
 
 		 833 aa  327  6e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  29.77 
 
 		 890 aa  327  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  29.64 
 
 		 890 aa  326  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.8 
 
 		 936 aa  326  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  29.13 
 
 		 874 aa  323  7e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  29.93 
 
 		 891 aa  323  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  30.28 
 
 		 890 aa  323  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  29.64 
 
 		 899 aa  321  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  30.38 
 
 		 893 aa  320  6e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  30.38 
 
 		 893 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  29.13 
 
 		 874 aa  320  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  30.38 
 
 		 912 aa  320  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  30.22 
 
 		 904 aa  320  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  30.1 
 
 		 903 aa  319  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  29.66 
 
 		 900 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  29.19 
 
 		 893 aa  319  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  29.46 
 
 		 900 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  29.47 
 
 		 892 aa  317  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.24 
 
 		 916 aa  315  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  28.98 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  29.1 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 		 852 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 890 aa  314  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  30.66 
 
 		 899 aa  314  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  29.63 
 
 		 891 aa  314  5.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 897 aa  313  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  28.98 
 
 		 890 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  28.73 
 
 		 900 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  29.06 
 
 		 890 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  31.27 
 
 		 989 aa  312  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.66 
 
 		 894 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  28.45 
 
 		 900 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  30.69 
 
 		 877 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  28.45 
 
 		 900 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  30.25 
 
 		 881 aa  307  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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