234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2275 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  100 
 
 		 895 aa  1824    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  33.78 
 
 		 1029 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.91 
 
 		 894 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  33.17 
 
 		 931 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  30.92 
 
 		 899 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.68 
 
 		 894 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  30.08 
 
 		 902 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.81 
 
 		 900 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  33.18 
 
 		 930 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.28 
 
 		 905 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  33.04 
 
 		 936 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  33.18 
 
 		 930 aa  376  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  33.57 
 
 		 930 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  30.9 
 
 		 934 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  31.88 
 
 		 928 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  29.68 
 
 		 898 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  31.73 
 
 		 914 aa  360  5e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  31.15 
 
 		 928 aa  360  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  31.15 
 
 		 928 aa  360  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  32.08 
 
 		 969 aa  359  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  31.54 
 
 		 937 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  30.66 
 
 		 935 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  31.54 
 
 		 934 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  31.31 
 
 		 934 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  32.08 
 
 		 931 aa  350  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  31.65 
 
 		 893 aa  346  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  31.83 
 
 		 931 aa  344  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  29.16 
 
 		 936 aa  344  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  31.05 
 
 		 943 aa  343  5.999999999999999e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  32.08 
 
 		 936 aa  343  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  30.36 
 
 		 906 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  31.52 
 
 		 931 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.52 
 
 		 864 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  30.52 
 
 		 949 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  31.05 
 
 		 933 aa  337  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  30.69 
 
 		 925 aa  337  7e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  30.16 
 
 		 968 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  30.7 
 
 		 932 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  30.85 
 
 		 933 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  29.76 
 
 		 941 aa  328  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  30.91 
 
 		 953 aa  324  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.62 
 
 		 938 aa  323  7e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  30.13 
 
 		 900 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 912 aa  320  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  30.14 
 
 		 899 aa  320  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  30.31 
 
 		 900 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  30.67 
 
 		 899 aa  319  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  31.01 
 
 		 899 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  29.65 
 
 		 900 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  29.65 
 
 		 900 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  29.65 
 
 		 900 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  30.41 
 
 		 877 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  29.8 
 
 		 892 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.88 
 
 		 924 aa  313  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  29.23 
 
 		 898 aa  313  9e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  30.36 
 
 		 900 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.41 
 
 		 930 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.41 
 
 		 930 aa  307  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.16 
 
 		 887 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.79 
 
 		 869 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  28.88 
 
 		 900 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.84 
 
 		 893 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 930 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  33.12 
 
 		 912 aa  300  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 927 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  28.73 
 
 		 856 aa  300  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  30.91 
 
 		 859 aa  299  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  30.91 
 
 		 859 aa  298  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  32.65 
 
 		 941 aa  298  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.46 
 
 		 894 aa  297  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  29.92 
 
 		 862 aa  297  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.92 
 
 		 862 aa  297  7e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.6 
 
 		 897 aa  295  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.28 
 
 		 936 aa  294  4e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 906 aa  294  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  28.88 
 
 		 898 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  28.25 
 
 		 851 aa  293  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.75 
 
 		 863 aa  292  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  29.04 
 
 		 859 aa  290  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 968 aa  290  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  28.47 
 
 		 900 aa  288  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  28.57 
 
 		 861 aa  287  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  27.95 
 
 		 857 aa  287  5e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  29.05 
 
 		 904 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  28.6 
 
 		 881 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 		 889 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  28.9 
 
 		 903 aa  283  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  28.33 
 
 		 852 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.75 
 
 		 870 aa  283  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 872 aa  282  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  30 
 
 		 858 aa  282  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  28.59 
 
 		 861 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 893 aa  281  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  27.94 
 
 		 865 aa  281  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  27.53 
 
 		 862 aa  281  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  27.56 
 
 		 862 aa  281  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  28.47 
 
 		 869 aa  281  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  29.52 
 
 		 891 aa  280  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  28.48 
 
 		 861 aa  280  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  27.26 
 
 		 892 aa  280  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>