232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2309 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  50.54 
 
 		 967 aa  803    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 872 aa  1746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  50.22 
 
 		 906 aa  795    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.57 
 
 		 887 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.45 
 
 		 833 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.61 
 
 		 864 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2269  (Protein-PII) uridylyltransferase  33.1 
 
 		 818 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.01 
 
 		 900 aa  344  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.44 
 
 		 905 aa  342  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.98 
 
 		 894 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  30.11 
 
 		 937 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.78 
 
 		 894 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  29.13 
 
 		 899 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  29.14 
 
 		 898 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  29.27 
 
 		 1029 aa  318  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  29.22 
 
 		 931 aa  317  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  28.76 
 
 		 902 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  28.74 
 
 		 925 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  29.43 
 
 		 936 aa  310  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.58 
 
 		 931 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  30.39 
 
 		 893 aa  310  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.86 
 
 		 933 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  31.49 
 
 		 930 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 933 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  28.94 
 
 		 936 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  27.43 
 
 		 931 aa  307  6e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  28.49 
 
 		 906 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 		 930 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28.94 
 
 		 969 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  31.64 
 
 		 930 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  31.64 
 
 		 930 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  29.2 
 
 		 943 aa  304  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.67 
 
 		 930 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.78 
 
 		 938 aa  303  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  30.04 
 
 		 936 aa  303  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.56 
 
 		 930 aa  301  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.49 
 
 		 932 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 		 927 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  27.06 
 
 		 931 aa  298  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  27.99 
 
 		 934 aa  297  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.7 
 
 		 924 aa  297  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  30.66 
 
 		 914 aa  296  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  28.86 
 
 		 928 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  28.86 
 
 		 928 aa  295  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  28.02 
 
 		 935 aa  295  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  28.44 
 
 		 928 aa  294  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  30.8 
 
 		 912 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  28.54 
 
 		 934 aa  291  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  28.42 
 
 		 934 aa  291  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 		 953 aa  288  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  29.47 
 
 		 989 aa  286  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  29.76 
 
 		 895 aa  282  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  30 
 
 		 941 aa  281  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  28.8 
 
 		 862 aa  277  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.8 
 
 		 862 aa  277  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  28.42 
 
 		 968 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  29.13 
 
 		 968 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 941 aa  271  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.1 
 
 		 893 aa  271  5e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  30.1 
 
 		 859 aa  269  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  30.1 
 
 		 859 aa  268  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  27.18 
 
 		 912 aa  268  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  28.75 
 
 		 900 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  28.64 
 
 		 881 aa  263  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 900 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  28.84 
 
 		 900 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  28.84 
 
 		 900 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.49 
 
 		 863 aa  260  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  28.04 
 
 		 852 aa  257  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  27.92 
 
 		 892 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  29.41 
 
 		 899 aa  256  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  29.61 
 
 		 899 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  27.95 
 
 		 899 aa  254  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.17 
 
 		 937 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  27.72 
 
 		 874 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  28.76 
 
 		 859 aa  252  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  28.67 
 
 		 858 aa  251  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25.86 
 
 		 900 aa  250  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 		 900 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  27.58 
 
 		 874 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  28.59 
 
 		 858 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  28.5 
 
 		 900 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  25.15 
 
 		 861 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  28.32 
 
 		 858 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  29.57 
 
 		 875 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  28.71 
 
 		 858 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  28.71 
 
 		 858 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01140  PII uridylyl-transferase  28.42 
 
 		 838 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  28.62 
 
 		 877 aa  245  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  27.46 
 
 		 856 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  28.98 
 
 		 858 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.38 
 
 		 894 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.85 
 
 		 869 aa  244  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  25.03 
 
 		 861 aa  244  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 858 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  28.27 
 
 		 858 aa  244  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 858 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 858 aa  244  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 858 aa  244  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 858 aa  244  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>