230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0864 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  50.54 
 
 		 872 aa  833    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 967 aa  1955    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  61.77 
 
 		 906 aa  1111    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.27 
 
 		 887 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.92 
 
 		 833 aa  393  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.45 
 
 		 864 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.61 
 
 		 894 aa  363  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  29.91 
 
 		 902 aa  360  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.43 
 
 		 905 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2269  (Protein-PII) uridylyltransferase  32.62 
 
 		 818 aa  356  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.08 
 
 		 894 aa  355  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  28.64 
 
 		 899 aa  352  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.21 
 
 		 930 aa  351  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.2 
 
 		 900 aa  350  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 930 aa  350  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.1 
 
 		 930 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 927 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  29.55 
 
 		 906 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  26.77 
 
 		 898 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  30.41 
 
 		 936 aa  322  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  29.81 
 
 		 938 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  29.81 
 
 		 941 aa  293  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  28.86 
 
 		 937 aa  292  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  29.15 
 
 		 934 aa  291  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  29.12 
 
 		 969 aa  287  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  27.86 
 
 		 968 aa  287  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.84 
 
 		 933 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  28.17 
 
 		 933 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.96 
 
 		 943 aa  283  7.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.39 
 
 		 968 aa  282  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  27.54 
 
 		 931 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  28.78 
 
 		 934 aa  278  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.96 
 
 		 863 aa  278  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.57 
 
 		 930 aa  277  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.57 
 
 		 932 aa  277  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  28.67 
 
 		 934 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.95 
 
 		 931 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.07 
 
 		 924 aa  276  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  27.04 
 
 		 925 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.56 
 
 		 894 aa  275  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  28.65 
 
 		 953 aa  274  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.22 
 
 		 930 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.22 
 
 		 930 aa  273  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  27.34 
 
 		 893 aa  271  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  29.44 
 
 		 856 aa  271  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.96 
 
 		 914 aa  271  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  28.92 
 
 		 949 aa  270  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 931 aa  269  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 931 aa  268  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  29.25 
 
 		 862 aa  265  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.25 
 
 		 862 aa  265  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  28.28 
 
 		 895 aa  264  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  26.38 
 
 		 900 aa  265  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.49 
 
 		 893 aa  263  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 912 aa  262  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  29.12 
 
 		 877 aa  261  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  28.44 
 
 		 892 aa  260  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  29.52 
 
 		 935 aa  260  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  30.34 
 
 		 858 aa  260  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.47 
 
 		 937 aa  260  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  28.73 
 
 		 941 aa  258  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  29.49 
 
 		 900 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  29.49 
 
 		 900 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  29.04 
 
 		 900 aa  254  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  29.04 
 
 		 900 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  26.27 
 
 		 878 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  29.04 
 
 		 859 aa  253  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  28.7 
 
 		 899 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 		 891 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  28.93 
 
 		 859 aa  251  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  23.33 
 
 		 869 aa  249  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  30.15 
 
 		 875 aa  250  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  27.6 
 
 		 861 aa  249  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  28.8 
 
 		 898 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  28.72 
 
 		 899 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  28.01 
 
 		 859 aa  247  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  28.97 
 
 		 857 aa  247  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  28.15 
 
 		 856 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 859 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  27.83 
 
 		 903 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  27.83 
 
 		 904 aa  244  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 899 aa  243  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  26.92 
 
 		 874 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  27.18 
 
 		 859 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  28.99 
 
 		 857 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  26.79 
 
 		 881 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  28.6 
 
 		 852 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  27.43 
 
 		 857 aa  241  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  28.92 
 
 		 890 aa  241  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  27.37 
 
 		 900 aa  241  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  28.49 
 
 		 893 aa  240  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  29.72 
 
 		 900 aa  240  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 		 858 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  27.23 
 
 		 900 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  28.85 
 
 		 858 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>