233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2269 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2269  (Protein-PII) uridylyltransferase  100 
 
 		 818 aa  1648    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 		 872 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 906 aa  353  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.62 
 
 		 967 aa  342  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
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NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.89 
 
 		 833 aa  302  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.95 
 
 		 864 aa  300  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
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NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.61 
 
 		 887 aa  298  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  28.28 
 
 		 902 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  27.34 
 
 		 899 aa  266  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.95 
 
 		 894 aa  257  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.87 
 
 		 894 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 898 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  27.29 
 
 		 906 aa  247  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.5 
 
 		 905 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  29.37 
 
 		 936 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  28.5 
 
 		 949 aa  240  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.53 
 
 		 900 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  28.16 
 
 		 937 aa  237  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.24 
 
 		 933 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 968 aa  235  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 931 aa  230  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
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NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  26.92 
 
 		 969 aa  229  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
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NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.23 
 
 		 933 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
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NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  28.94 
 
 		 938 aa  226  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.4 
 
 		 934 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  27.45 
 
 		 930 aa  224  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
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NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.28 
 
 		 931 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.46 
 
 		 931 aa  220  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 935 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
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NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  26.91 
 
 		 943 aa  219  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.29 
 
 		 931 aa  219  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  26.44 
 
 		 925 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
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NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.16 
 
 		 930 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  26.63 
 
 		 932 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
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NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 857 aa  218  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.83 
 
 		 930 aa  218  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 912 aa  217  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.09 
 
 		 936 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.27 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.56 
 
 		 914 aa  216  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
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NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30 
 
 		 862 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
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NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  30 
 
 		 862 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.71 
 
 		 894 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.86 
 
 		 893 aa  214  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  26.44 
 
 		 953 aa  212  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  25.77 
 
 		 859 aa  208  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
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NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  28.06 
 
 		 890 aa  207  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  25.4 
 
 		 856 aa  207  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
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NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  25.85 
 
 		 859 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
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NC_008009  Acid345_1488  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.45 
 
 		 873 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  24.44 
 
 		 857 aa  206  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.71 
 
 		 924 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  28.03 
 
 		 904 aa  204  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  28.16 
 
 		 903 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  26.71 
 
 		 861 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
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NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.57 
 
 		 863 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  27.02 
 
 		 892 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  26.43 
 
 		 861 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  26.42 
 
 		 860 aa  201  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  26.44 
 
 		 878 aa  201  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  26.42 
 
 		 861 aa  201  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  26.59 
 
 		 861 aa  200  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 861 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  26.12 
 
 		 881 aa  199  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  26.05 
 
 		 861 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  25.93 
 
 		 861 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  26.05 
 
 		 861 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  28.12 
 
 		 893 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  26.29 
 
 		 874 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  26.59 
 
 		 941 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  26.06 
 
 		 900 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  26.36 
 
 		 883 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  27.58 
 
 		 861 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  26.67 
 
 		 862 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  27.15 
 
 		 890 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  27.78 
 
 		 890 aa  192  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  26.77 
 
 		 862 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  27.66 
 
 		 890 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  27.66 
 
 		 890 aa  191  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  27.15 
 
 		 890 aa  191  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  27.66 
 
 		 890 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  27.66 
 
 		 890 aa  191  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  27.66 
 
 		 890 aa  191  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  26.18 
 
 		 900 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.42 
 
 		 890 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  27.66 
 
 		 890 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  26.18 
 
 		 900 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  25.98 
 
 		 874 aa  190  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  26.18 
 
 		 900 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  26.91 
 
 		 890 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  26.91 
 
 		 890 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  24.64 
 
 		 851 aa  188  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 890 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  27.36 
 
 		 899 aa  187  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  27.54 
 
 		 890 aa  187  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  25.92 
 
 		 898 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  23.73 
 
 		 900 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  24.26 
 
 		 861 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 899 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  26.96 
 
 		 893 aa  185  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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