244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2333 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  66.41 
 
 		 902 aa  1245    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  49.32 
 
 		 906 aa  869    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  67.85 
 
 		 899 aa  1272    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  59.55 
 
 		 900 aa  1082    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  71.06 
 
 		 898 aa  1325    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  59.25 
 
 		 905 aa  1085    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  96.76 
 
 		 894 aa  1757    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 894 aa  1828    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.75 
 
 		 924 aa  569  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.72 
 
 		 930 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  35.99 
 
 		 931 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.45 
 
 		 930 aa  532  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  36.76 
 
 		 936 aa  527  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 		 930 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 927 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  34.49 
 
 		 928 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  34.04 
 
 		 930 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  35.11 
 
 		 935 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  34.51 
 
 		 936 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 		 928 aa  499  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 		 928 aa  499  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  34.04 
 
 		 930 aa  496  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.94 
 
 		 887 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  35.59 
 
 		 893 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  34.15 
 
 		 938 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  34.04 
 
 		 930 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  33.3 
 
 		 936 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  34.07 
 
 		 937 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  32.49 
 
 		 943 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  33.15 
 
 		 933 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  34.38 
 
 		 953 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  33.52 
 
 		 1029 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  33.04 
 
 		 933 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.96 
 
 		 864 aa  475  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  32.52 
 
 		 914 aa  473  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  33.22 
 
 		 931 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  33.76 
 
 		 934 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  34.59 
 
 		 912 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  33.59 
 
 		 969 aa  464  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  33.45 
 
 		 931 aa  465  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 		 935 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  34.63 
 
 		 934 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  33.06 
 
 		 932 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  34.04 
 
 		 949 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  32.48 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  34.26 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 		 941 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  33.26 
 
 		 941 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  31.87 
 
 		 925 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  33.53 
 
 		 899 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  33.15 
 
 		 989 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  32.11 
 
 		 968 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  32.11 
 
 		 968 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 		 912 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 899 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  31.7 
 
 		 897 aa  422  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.26 
 
 		 894 aa  422  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.7 
 
 		 937 aa  419  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0911  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.45 
 
 		 869 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0590942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.6 
 
 		 916 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  31.58 
 
 		 899 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  31.31 
 
 		 898 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.33 
 
 		 893 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  33.02 
 
 		 895 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  31.28 
 
 		 900 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 900 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  31.51 
 
 		 900 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  31.39 
 
 		 900 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  32.6 
 
 		 900 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  30.94 
 
 		 900 aa  406  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2294  PII uridylyl-transferase  32.48 
 
 		 884 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0510748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  32.36 
 
 		 884 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  31.38 
 
 		 885 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 		 889 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  30.86 
 
 		 895 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  31.18 
 
 		 852 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  30.62 
 
 		 900 aa  399  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  32.15 
 
 		 900 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  30.34 
 
 		 858 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  31.89 
 
 		 898 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  30.35 
 
 		 858 aa  396  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  32.08 
 
 		 891 aa  392  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  30.01 
 
 		 858 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  30.01 
 
 		 858 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  30.01 
 
 		 858 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  30.01 
 
 		 858 aa  393  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  30.01 
 
 		 858 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  31.23 
 
 		 877 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  31.41 
 
 		 892 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  31.58 
 
 		 859 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  28.84 
 
 		 861 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  29.08 
 
 		 861 aa  386  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  30.88 
 
 		 869 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  30.16 
 
 		 881 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  31.21 
 
 		 859 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3611  PII uridylyl-transferase  32.24 
 
 		 893 aa  382  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434009  normal  0.951949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 884 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  31.36 
 
 		 862 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  31.75 
 
 		 861 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  30.14 
 
 		 857 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>