233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1829 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  62.09 
 
 
967 aa  1098    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  50.22 
 
 
872 aa  808    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
906 aa  1805    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  36.14 
 
 
887 aa  445  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.26 
 
 
833 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.64 
 
 
900 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.38 
 
 
864 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  31.16 
 
 
899 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  31.01 
 
 
902 aa  357  5e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.29 
 
 
894 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2269  (Protein-PII) uridylyltransferase  33.37 
 
 
818 aa  353  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.77 
 
 
905 aa  350  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.47 
 
 
894 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.04 
 
 
930 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.81 
 
 
930 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 
930 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 
898 aa  337  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  29.86 
 
 
906 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 
927 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  28.79 
 
 
931 aa  318  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  30.29 
 
 
937 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.95 
 
 
933 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2275  protein-P-II uridylyltransferase  29.27 
 
 
895 aa  304  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  28.2 
 
 
931 aa  303  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  28.98 
 
 
933 aa  301  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  28.29 
 
 
968 aa  298  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  29.11 
 
 
968 aa  297  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  28.87 
 
 
932 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  30.02 
 
 
938 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  30.31 
 
 
969 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  29.43 
 
 
936 aa  294  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  28.65 
 
 
925 aa  292  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.57 
 
 
924 aa  292  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  30.16 
 
 
941 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  28.49 
 
 
1029 aa  291  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  28.37 
 
 
928 aa  290  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  28.82 
 
 
934 aa  290  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  27.21 
 
 
900 aa  289  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  28.48 
 
 
928 aa  289  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  29.93 
 
 
953 aa  287  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  28.6 
 
 
928 aa  287  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  28.16 
 
 
931 aa  286  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.25 
 
 
931 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  30.79 
 
 
862 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.79 
 
 
862 aa  286  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  29.61 
 
 
949 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  29.66 
 
 
899 aa  284  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  28.59 
 
 
912 aa  281  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.28 
 
 
894 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  28.74 
 
 
934 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  28.49 
 
 
930 aa  277  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  27.88 
 
 
893 aa  276  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  27.5 
 
 
878 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  27.29 
 
 
936 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.65 
 
 
937 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  28.65 
 
 
934 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  27.48 
 
 
935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  28.32 
 
 
900 aa  274  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.79 
 
 
863 aa  272  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1488  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  29.31 
 
 
873 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  29.82 
 
 
859 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  28.12 
 
 
900 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 
900 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  28.17 
 
 
900 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  30.98 
 
 
935 aa  270  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.14 
 
 
893 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 
897 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 
930 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 
930 aa  268  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  28 
 
 
899 aa  268  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  27.49 
 
 
856 aa  268  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  30.88 
 
 
858 aa  267  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  29.36 
 
 
858 aa  268  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  30.53 
 
 
885 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  27.84 
 
 
900 aa  267  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  29.38 
 
 
858 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  29.38 
 
 
858 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  29.38 
 
 
858 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  29.38 
 
 
858 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  29.38 
 
 
858 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  27.65 
 
 
852 aa  266  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  29.15 
 
 
892 aa  265  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  29.66 
 
 
899 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  27.93 
 
 
900 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  28.91 
 
 
890 aa  265  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  29.27 
 
 
858 aa  265  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  29.54 
 
 
859 aa  265  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  29.38 
 
 
858 aa  263  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  29.52 
 
 
881 aa  263  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  29.51 
 
 
874 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  27.53 
 
 
898 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 
861 aa  261  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  28.96 
 
 
912 aa  259  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  28.73 
 
 
893 aa  258  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  28.17 
 
 
903 aa  258  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  28.95 
 
 
858 aa  258  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  27.77 
 
 
883 aa  257  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  28.81 
 
 
857 aa  257  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  28.62 
 
 
856 aa  257  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  29.08 
 
 
858 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>