237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2799 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  100 
 
 
937 aa  1909    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  59.15 
 
 
1029 aa  1037    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  54.74 
 
 
934 aa  961    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  40.33 
 
 
943 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  55.45 
 
 
925 aa  968    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  69.48 
 
 
953 aa  1260    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  42 
 
 
930 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  41.56 
 
 
930 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  44.31 
 
 
936 aa  738    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  59.64 
 
 
936 aa  1030    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  54.16 
 
 
932 aa  971    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  45.36 
 
 
912 aa  741    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  41.42 
 
 
914 aa  671    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  53.27 
 
 
931 aa  971    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  54.32 
 
 
934 aa  966    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  53.74 
 
 
933 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  54.78 
 
 
931 aa  972    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  56.98 
 
 
969 aa  1019    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  53.16 
 
 
949 aa  920    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  41.9 
 
 
893 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  45.97 
 
 
935 aa  719    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  59.7 
 
 
935 aa  1043    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  52.7 
 
 
912 aa  915    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  59.27 
 
 
928 aa  1049    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  54.32 
 
 
931 aa  938    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  54.51 
 
 
968 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  43.59 
 
 
936 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  54.63 
 
 
934 aa  959    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  45.22 
 
 
941 aa  675    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  43.39 
 
 
938 aa  664    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  52.47 
 
 
941 aa  918    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  59.27 
 
 
928 aa  1049    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  41.89 
 
 
930 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  59.6 
 
 
928 aa  1047    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  53.72 
 
 
933 aa  982    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  54.17 
 
 
968 aa  931    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  53.86 
 
 
931 aa  962    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  39.18 
 
 
989 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.12 
 
 
936 aa  556  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.96 
 
 
924 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.3 
 
 
894 aa  486  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  32.77 
 
 
899 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.15 
 
 
894 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  33.59 
 
 
902 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.11 
 
 
900 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  35.22 
 
 
890 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  35.49 
 
 
893 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.76 
 
 
899 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 
898 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  35.53 
 
 
899 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  36.05 
 
 
927 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  35.27 
 
 
893 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 
892 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.72 
 
 
899 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.22 
 
 
905 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  34.81 
 
 
890 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  34.81 
 
 
890 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  33.66 
 
 
900 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  34.81 
 
 
890 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  34.47 
 
 
900 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  34.81 
 
 
890 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.56 
 
 
890 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  34.35 
 
 
900 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  34.81 
 
 
890 aa  432  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  34.69 
 
 
890 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  34.81 
 
 
890 aa  432  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  34.27 
 
 
900 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  34.56 
 
 
890 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  34.23 
 
 
900 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  35.01 
 
 
877 aa  429  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  34.5 
 
 
900 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  34.38 
 
 
900 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  34.12 
 
 
903 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  34.53 
 
 
904 aa  429  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
930 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.98 
 
 
930 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  33.13 
 
 
892 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  31.49 
 
 
906 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  35.38 
 
 
859 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.79 
 
 
930 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.24 
 
 
894 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 
890 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 
890 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 
890 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  33.78 
 
 
890 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  33.05 
 
 
898 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  33.78 
 
 
890 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  31.88 
 
 
900 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  35.13 
 
 
859 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  33.99 
 
 
852 aa  416  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  34.55 
 
 
850 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  33.78 
 
 
857 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 
891 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 
857 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  33.6 
 
 
889 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  33.01 
 
 
859 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  33.29 
 
 
859 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  33.54 
 
 
851 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  32.8 
 
 
862 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.423567 
 
 
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NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  33.74 
 
 
912 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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