265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2005 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 937 aa  1914    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.24 
 
 		 900 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.28 
 
 		 905 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  31.48 
 
 		 902 aa  436  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  30.86 
 
 		 898 aa  436  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  30.2 
 
 		 899 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31 
 
 		 894 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.48 
 
 		 894 aa  429  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  31.54 
 
 		 906 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  31.11 
 
 		 941 aa  386  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.67 
 
 		 924 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  30.74 
 
 		 936 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  31.05 
 
 		 938 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.75 
 
 		 930 aa  364  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  32.53 
 
 		 949 aa  364  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.81 
 
 		 930 aa  364  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  32.44 
 
 		 934 aa  363  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  31.35 
 
 		 930 aa  363  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  32.44 
 
 		 934 aa  363  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  30.87 
 
 		 934 aa  360  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  29.39 
 
 		 931 aa  360  8e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  30.37 
 
 		 943 aa  360  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.91 
 
 		 887 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  31.42 
 
 		 935 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  31.02 
 
 		 914 aa  356  1e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
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NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  30.11 
 
 		 953 aa  356  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  30.75 
 
 		 912 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  30.9 
 
 		 930 aa  350  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  29.13 
 
 		 935 aa  349  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  29.74 
 
 		 899 aa  349  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  31.38 
 
 		 899 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  29.13 
 
 		 933 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  29.27 
 
 		 912 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  30.06 
 
 		 936 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.02 
 
 		 927 aa  343  8e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  29.59 
 
 		 937 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  29.55 
 
 		 931 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  28.85 
 
 		 928 aa  341  4e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  30.12 
 
 		 969 aa  340  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  29.99 
 
 		 930 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  29.99 
 
 		 930 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  29.39 
 
 		 900 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
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NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  28.15 
 
 		 928 aa  337  5e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  28.15 
 
 		 928 aa  337  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
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NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  29.39 
 
 		 900 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  29.51 
 
 		 931 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  28.95 
 
 		 898 aa  336  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  29.2 
 
 		 900 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  29.93 
 
 		 1029 aa  335  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 900 aa  335  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.7 
 
 		 893 aa  334  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  28.51 
 
 		 900 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  30.83 
 
 		 877 aa  332  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  29.68 
 
 		 890 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  30.16 
 
 		 862 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.16 
 
 		 862 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 933 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  29.2 
 
 		 932 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  28.74 
 
 		 900 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  30.18 
 
 		 941 aa  326  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  29.74 
 
 		 893 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  28.74 
 
 		 931 aa  323  7e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  28.08 
 
 		 925 aa  323  9.000000000000001e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  28.64 
 
 		 893 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  27.94 
 
 		 852 aa  320  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  28.32 
 
 		 899 aa  320  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  29.07 
 
 		 890 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  28.66 
 
 		 989 aa  318  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  29.56 
 
 		 889 aa  318  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  28.85 
 
 		 892 aa  317  8e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  28.99 
 
 		 890 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.81 
 
 		 890 aa  316  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  29.59 
 
 		 968 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  28.79 
 
 		 898 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  28.89 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  29.05 
 
 		 936 aa  315  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 890 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  30.16 
 
 		 891 aa  314  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  28.89 
 
 		 890 aa  313  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.3 
 
 		 894 aa  312  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 897 aa  311  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  28.2 
 
 		 900 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  29.07 
 
 		 904 aa  310  8e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  28.56 
 
 		 884 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  28.87 
 
 		 891 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  29.26 
 
 		 903 aa  307  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  29.03 
 
 		 968 aa  307  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  29.84 
 
 		 858 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1580  PII uridylyl-transferase  29.08 
 
 		 884 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  28.5 
 
 		 892 aa  304  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  28.31 
 
 		 890 aa  303  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
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NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  28.41 
 
 		 881 aa  303  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  29.7 
 
 		 885 aa  303  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 890 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 890 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.16 
 
 		 864 aa  302  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  28.21 
 
 		 890 aa  302  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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