238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0682 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  45.94 
 
 		 934 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  46.39 
 
 		 928 aa  772    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  46.27 
 
 		 1029 aa  756    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  45.99 
 
 		 935 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  43.92 
 
 		 968 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  45.81 
 
 		 925 aa  753    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  44.81 
 
 		 930 aa  726    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  46.61 
 
 		 928 aa  777    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  47.89 
 
 		 936 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  49.83 
 
 		 931 aa  857    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  45.2 
 
 		 933 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  46.1 
 
 		 932 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 912 aa  1843    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  44.31 
 
 		 914 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  44.75 
 
 		 931 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  45.23 
 
 		 934 aa  768    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  45.81 
 
 		 933 aa  755    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  44.84 
 
 		 931 aa  754    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  45.32 
 
 		 949 aa  766    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  43.98 
 
 		 893 aa  693    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  69.4 
 
 		 935 aa  1223    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  43.81 
 
 		 968 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  46.13 
 
 		 936 aa  751    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  46.36 
 
 		 912 aa  756    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  46.39 
 
 		 969 aa  764    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  44.31 
 
 		 943 aa  729    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  43.33 
 
 		 941 aa  641    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  45.8 
 
 		 931 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  43.72 
 
 		 936 aa  703    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  45.82 
 
 		 934 aa  786    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  44.27 
 
 		 941 aa  709    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  46.15 
 
 		 937 aa  736    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  45.98 
 
 		 953 aa  736    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  44.81 
 
 		 930 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  44.27 
 
 		 930 aa  723    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  46.39 
 
 		 928 aa  772    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  43.88 
 
 		 938 aa  631  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  41.43 
 
 		 989 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2766  (protein-PII) uridylyltransferase  61.75 
 
 		 487 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.66342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.02 
 
 		 924 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2768  metal dependent phosphohydrolase  64.25 
 
 		 439 aa  539  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.743155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.23 
 
 		 936 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  32.35 
 
 		 899 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.31 
 
 		 894 aa  465  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.59 
 
 		 894 aa  465  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  33.37 
 
 		 902 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  31.6 
 
 		 898 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  35.29 
 
 		 899 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.22 
 
 		 894 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.86 
 
 		 900 aa  443  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  33.77 
 
 		 899 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 		 891 aa  442  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.08 
 
 		 893 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
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NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  32.03 
 
 		 856 aa  439  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  33.17 
 
 		 900 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  32.99 
 
 		 890 aa  433  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  32.12 
 
 		 900 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  33.13 
 
 		 900 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  32.94 
 
 		 900 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  34.6 
 
 		 877 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  32.86 
 
 		 900 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.66 
 
 		 899 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  33.33 
 
 		 893 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  32.97 
 
 		 906 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  32.51 
 
 		 900 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.7 
 
 		 905 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 		 897 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  33.72 
 
 		 887 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  32.26 
 
 		 881 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 889 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  32.8 
 
 		 900 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  32.15 
 
 		 892 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  30.62 
 
 		 900 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  32.49 
 
 		 890 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  32.48 
 
 		 904 aa  412  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.37 
 
 		 890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  34.31 
 
 		 859 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  32.28 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  32.25 
 
 		 890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  34.4 
 
 		 859 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 890 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 890 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.17 
 
 		 864 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  32.25 
 
 		 890 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  32.64 
 
 		 874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  32.23 
 
 		 903 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  32.29 
 
 		 874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  32.72 
 
 		 892 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  32.13 
 
 		 890 aa  405  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  33.79 
 
 		 858 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  32.16 
 
 		 858 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  32.52 
 
 		 898 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
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NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  32.69 
 
 		 852 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  33.79 
 
 		 850 aa  403  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  33.17 
 
 		 862 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 899 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
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NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  33.71 
 
 		 858 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  33.46 
 
 		 862 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
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