274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3267 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 707 aa  1339    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  43.82 
 
 		 786 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
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NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  46.86 
 
 		 761 aa  456  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.38 
 
 		 791 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.47 
 
 		 780 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  43.9 
 
 		 771 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
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NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  43.3 
 
 		 778 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
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NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  42.92 
 
 		 785 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
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NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  42.94 
 
 		 812 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
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NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  41.67 
 
 		 764 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  38.62 
 
 		 837 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  38.62 
 
 		 837 aa  382  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  40.49 
 
 		 787 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  38.48 
 
 		 837 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  38.01 
 
 		 808 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  38.24 
 
 		 824 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
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NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  38.09 
 
 		 822 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  40.71 
 
 		 764 aa  348  3e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
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NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 		 598 aa  336  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
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NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  43 
 
 		 640 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
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NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  40.08 
 
 		 817 aa  333  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.34 
 
 		 832 aa  333  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  35.74 
 
 		 860 aa  326  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44 
 
 		 622 aa  318  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  38.6 
 
 		 596 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 		 582 aa  304  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
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NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  37.48 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  27.65 
 
 		 914 aa  231  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
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NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  27.48 
 
 		 931 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.59 
 
 		 930 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.59 
 
 		 930 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.85 
 
 		 932 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
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NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.01 
 
 		 864 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  26.84 
 
 		 930 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
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NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.16 
 
 		 924 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  27.1 
 
 		 943 aa  218  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  27.4 
 
 		 937 aa  216  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  27.87 
 
 		 969 aa  216  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
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NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 933 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
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NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  27.4 
 
 		 931 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  27.34 
 
 		 931 aa  213  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.95 
 
 		 887 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  27.4 
 
 		 933 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.12 
 
 		 894 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  27.97 
 
 		 941 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.01 
 
 		 902 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 		 934 aa  201  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.88 
 
 		 931 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  26.24 
 
 		 925 aa  198  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
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NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 		 893 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.37 
 
 		 949 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  27.99 
 
 		 912 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  25.53 
 
 		 968 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
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NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 898 aa  194  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.22 
 
 		 894 aa  194  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.16 
 
 		 934 aa  193  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.61 
 
 		 927 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
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NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.64 
 
 		 934 aa  193  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  23.99 
 
 		 900 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  30.16 
 
 		 938 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.45 
 
 		 930 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  24.78 
 
 		 968 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  26.4 
 
 		 861 aa  190  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  27.11 
 
 		 928 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  25.94 
 
 		 936 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  26.37 
 
 		 869 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
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NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 858 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 858 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  26.93 
 
 		 935 aa  188  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.45 
 
 		 930 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 858 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  27.5 
 
 		 858 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  24.25 
 
 		 899 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 928 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  25.87 
 
 		 900 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 928 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  24.53 
 
 		 899 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  27.58 
 
 		 935 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  27.63 
 
 		 858 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  25.16 
 
 		 899 aa  184  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  27.5 
 
 		 858 aa  184  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  27.28 
 
 		 858 aa  183  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  25.66 
 
 		 857 aa  183  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  26.02 
 
 		 862 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  25.89 
 
 		 862 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  27.82 
 
 		 859 aa  180  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  27.76 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  29.24 
 
 		 936 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  25.41 
 
 		 900 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  26.35 
 
 		 895 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  27.8 
 
 		 858 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  26.49 
 
 		 953 aa  179  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  25.19 
 
 		 900 aa  178  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.49 
 
 		 905 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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