240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1467 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  65.79 
 
 
640 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  68.75 
 
 
622 aa  685    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
598 aa  1134    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  67.51 
 
 
582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.58 
 
 
571 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  56.84 
 
 
778 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  42.28 
 
 
596 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  47.92 
 
 
786 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  48.56 
 
 
761 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.47 
 
 
780 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.5 
 
 
832 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  46.08 
 
 
707 aa  356  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  42.34 
 
 
808 aa  349  8e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  41.18 
 
 
837 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  41.18 
 
 
837 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.75 
 
 
791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  40.99 
 
 
837 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  44.85 
 
 
785 aa  334  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  41.18 
 
 
822 aa  333  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  40.56 
 
 
824 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  45.92 
 
 
764 aa  330  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  45.75 
 
 
812 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  42.83 
 
 
787 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  44.55 
 
 
771 aa  316  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.08 
 
 
817 aa  316  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  45.11 
 
 
764 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  38.73 
 
 
860 aa  301  3e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  27.01 
 
 
902 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.63 
 
 
900 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.55 
 
 
864 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.48 
 
 
899 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  28.85 
 
 
943 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  27.87 
 
 
968 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  26.09 
 
 
906 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  28.17 
 
 
968 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.24 
 
 
894 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  28.04 
 
 
949 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.54 
 
 
894 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  28.97 
 
 
899 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.15 
 
 
930 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.15 
 
 
930 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  26.84 
 
 
874 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.57 
 
 
933 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  28.19 
 
 
914 aa  160  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.2 
 
 
930 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  27.33 
 
 
874 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  28.65 
 
 
938 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.11 
 
 
869 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  28.7 
 
 
936 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  24.33 
 
 
898 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 
927 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25 
 
 
900 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  28.67 
 
 
930 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.48 
 
 
924 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  26.21 
 
 
881 aa  154  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  25.47 
 
 
941 aa  154  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  26.04 
 
 
883 aa  153  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 
934 aa  153  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  27.7 
 
 
895 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 
889 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  27.64 
 
 
969 aa  151  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  26.01 
 
 
931 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 
930 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.14 
 
 
930 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.41 
 
 
887 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  23.61 
 
 
905 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.06 
 
 
931 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.81 
 
 
894 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  23.49 
 
 
861 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1274  PII uridylyl-transferase  30 
 
 
875 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925276  normal  0.847254 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  23.31 
 
 
861 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 
897 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  27.27 
 
 
877 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  27.94 
 
 
893 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  27.59 
 
 
941 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.88 
 
 
934 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  28.3 
 
 
858 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.64 
 
 
931 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.88 
 
 
934 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  24.25 
 
 
891 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  26.4 
 
 
899 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  25.08 
 
 
903 aa  144  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  27.69 
 
 
935 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  25.96 
 
 
925 aa  143  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  25.34 
 
 
904 aa  143  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  23.28 
 
 
888 aa  143  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  25.83 
 
 
890 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  26.16 
 
 
936 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.49 
 
 
933 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  25.69 
 
 
892 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.87 
 
 
882 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  25.96 
 
 
893 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  26.85 
 
 
852 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  29.58 
 
 
935 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.52 
 
 
893 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.26 
 
 
916 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  26.64 
 
 
859 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  24.28 
 
 
857 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  26.7 
 
 
857 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  28.5 
 
 
872 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>