259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  66.15 
 
 		 598 aa  693    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  100 
 
 		 640 aa  1231    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  65.92 
 
 		 622 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  64.31 
 
 		 582 aa  558  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  51.19 
 
 		 571 aa  511  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  55.76 
 
 		 778 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  43.05 
 
 		 596 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.28 
 
 		 780 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  44.68 
 
 		 786 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  47.61 
 
 		 761 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  42.68 
 
 		 808 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.2 
 
 		 832 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  40.82 
 
 		 837 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  40.82 
 
 		 837 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  42.75 
 
 		 707 aa  345  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  40.65 
 
 		 837 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  44.22 
 
 		 785 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  45.02 
 
 		 764 aa  331  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  40.33 
 
 		 824 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.02 
 
 		 791 aa  330  6e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.98 
 
 		 817 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  43.35 
 
 		 771 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  40.29 
 
 		 822 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  45.21 
 
 		 812 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  42.78 
 
 		 764 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  42.45 
 
 		 787 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  41.61 
 
 		 860 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  26.26 
 
 		 902 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.32 
 
 		 900 aa  197  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  25.21 
 
 		 899 aa  186  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.21 
 
 		 905 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.28 
 
 		 930 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 927 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.37 
 
 		 933 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 930 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.11 
 
 		 930 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  28.72 
 
 		 930 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.76 
 
 		 894 aa  167  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  25.85 
 
 		 883 aa  167  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.73 
 
 		 914 aa  165  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.78 
 
 		 894 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  28.37 
 
 		 938 aa  163  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.83 
 
 		 931 aa  162  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.94 
 
 		 924 aa  161  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28.75 
 
 		 969 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  29.57 
 
 		 893 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  28.1 
 
 		 936 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  26.41 
 
 		 933 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 		 898 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  28.55 
 
 		 930 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  28.45 
 
 		 930 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.88 
 
 		 949 aa  157  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.56 
 
 		 864 aa  156  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  26.76 
 
 		 943 aa  156  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  26.81 
 
 		 934 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  26.17 
 
 		 941 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  25.13 
 
 		 906 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  25.38 
 
 		 881 aa  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  26.73 
 
 		 968 aa  154  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  26.1 
 
 		 874 aa  153  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  26.73 
 
 		 968 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  25.86 
 
 		 900 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  26.26 
 
 		 899 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.68 
 
 		 934 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  27.65 
 
 		 932 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  26.61 
 
 		 874 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.68 
 
 		 934 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.34 
 
 		 931 aa  151  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  27.42 
 
 		 912 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  26.12 
 
 		 925 aa  150  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 931 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  27.72 
 
 		 890 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  27.26 
 
 		 941 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  25.86 
 
 		 890 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  26.43 
 
 		 937 aa  147  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.01 
 
 		 931 aa  147  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  25.69 
 
 		 890 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  25.69 
 
 		 890 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4853  PII uridylyl-transferase  26.77 
 
 		 895 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.826646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.52 
 
 		 894 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  25.69 
 
 		 890 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  25.13 
 
 		 891 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  26.93 
 
 		 904 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  25.69 
 
 		 890 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.84 
 
 		 869 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  24.67 
 
 		 897 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  27.1 
 
 		 903 aa  144  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  25.47 
 
 		 899 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  27.67 
 
 		 858 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2021  PII uridylyl-transferase  27.67 
 
 		 858 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  26.48 
 
 		 893 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5331  PII uridylyl-transferase  27.3 
 
 		 858 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345474  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  26.12 
 
 		 890 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  25.38 
 
 		 852 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  27.14 
 
 		 936 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  25.95 
 
 		 935 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  26.88 
 
 		 892 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.52 
 
 		 893 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  26.87 
 
 		 858 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  26.34 
 
 		 893 aa  140  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>