232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1164 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  100 
 
 		 622 aa  1184    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1467  metal dependent phosphohydrolase  68.73 
 
 		 598 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.407814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23780  UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase  64.23 
 
 		 640 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.259899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2545  metal dependent phosphohydrolase  62.36 
 
 		 582 aa  531  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.15949 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0982  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  48.08 
 
 		 571 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1395  PII uridylyl-transferase  54.39 
 
 		 778 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  decreased coverage  0.00675271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1234  protein-p-II uridylyltransferase  42.45 
 
 		 596 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3425  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  45.98 
 
 		 780 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000721047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1787  (Protein-PII) uridylyltransferase  48.4 
 
 		 761 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3147  PII uridylyl-transferase  45.08 
 
 		 786 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00573062  normal  0.0612355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3267  PII uridylyl-transferase  44 
 
 		 707 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4013  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.47 
 
 		 791 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0410542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12932  PII uridylyl-transferase  40.45 
 
 		 808 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000204845  normal  0.298012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1564  PII uridylyl-transferase  44.31 
 
 		 771 aa  317  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.694089  normal  0.0576008 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2180  PII uridylyl-transferase  40.22 
 
 		 822 aa  316  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1958  PII uridylyl-transferase  39.74 
 
 		 837 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2004  PII uridylyl-transferase  39.74 
 
 		 837 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147451  normal  0.662408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4183  PII uridylyl-transferase  39.85 
 
 		 824 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307556  normal  0.381619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1938  PII uridylyl-transferase  39.55 
 
 		 837 aa  309  9e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0420  PII uridylyl-transferase  44.61 
 
 		 785 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1610  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.7 
 
 		 817 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00765981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5932  PII uridylyl-transferase  43.38 
 
 		 787 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6202  PII uridylyl-transferase  42.86 
 
 		 812 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0708952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1189  PII uridylyl-transferase  41.58 
 
 		 764 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.846826  hitchhiker  0.00590084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2080  protein-P-II uridylyltransferase  37.37 
 
 		 860 aa  280  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1300  PII uridylyl-transferase  40.29 
 
 		 764 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.619791  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7998  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.17 
 
 		 832 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  27.54 
 
 		 902 aa  190  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  26.94 
 
 		 899 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.31 
 
 		 864 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 		 930 aa  173  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  28.36 
 
 		 933 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.09 
 
 		 930 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  30.09 
 
 		 930 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  30.45 
 
 		 927 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.94 
 
 		 900 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  28.75 
 
 		 969 aa  163  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  27.67 
 
 		 934 aa  163  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  29.03 
 
 		 899 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.52 
 
 		 894 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  26.11 
 
 		 931 aa  160  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.54 
 
 		 894 aa  160  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  29.32 
 
 		 912 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  26.56 
 
 		 931 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  28.77 
 
 		 859 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  29.06 
 
 		 943 aa  159  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  26.76 
 
 		 932 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  27.3 
 
 		 933 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  26.32 
 
 		 931 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  28.92 
 
 		 938 aa  152  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  26.51 
 
 		 934 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 		 898 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  25.48 
 
 		 906 aa  152  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  26.51 
 
 		 934 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  29.64 
 
 		 935 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  28.3 
 
 		 930 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  26.34 
 
 		 925 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  27.33 
 
 		 912 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.82 
 
 		 924 aa  152  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.48 
 
 		 905 aa  151  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  26.51 
 
 		 914 aa  150  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  27.82 
 
 		 857 aa  150  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  26.52 
 
 		 890 aa  150  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  26.7 
 
 		 968 aa  150  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  27.4 
 
 		 931 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  27.53 
 
 		 890 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  26.06 
 
 		 968 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  26.72 
 
 		 936 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  25.44 
 
 		 874 aa  147  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  27.9 
 
 		 936 aa  147  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  26.89 
 
 		 949 aa  146  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  26.22 
 
 		 857 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  27.71 
 
 		 890 aa  147  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  27.35 
 
 		 890 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  27.35 
 
 		 890 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  26.95 
 
 		 891 aa  146  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  25.49 
 
 		 874 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  27.16 
 
 		 936 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  27.35 
 
 		 890 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  27.23 
 
 		 930 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  27.33 
 
 		 861 aa  145  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  27.46 
 
 		 930 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  27.68 
 
 		 861 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  27.21 
 
 		 1029 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  26.54 
 
 		 935 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  26.8 
 
 		 851 aa  144  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  27.56 
 
 		 856 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  27.03 
 
 		 893 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  29.01 
 
 		 941 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  27.96 
 
 		 861 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  24.7 
 
 		 881 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  26.09 
 
 		 893 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2877  protein-P-II uridylyltransferase  26.23 
 
 		 874 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.521501  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  27.38 
 
 		 861 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 890 aa  142  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  26.9 
 
 		 937 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 890 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  27.2 
 
 		 859 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  26.82 
 
 		 890 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  24.84 
 
 		 904 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>